手机版 | 登陆 | 注册 | 留言 | 设首页 | 加收藏
当前位置: 网站首页 > 疫病防控 > 监测流调 > 文章

2017年H5亚型禽流感流行毒株变异情况研究及分析

时间:2018-07-05    点击: 次    来源:广东省动物疫病预防控制中心    作者:卢受昇等 - 小 + 大

图2 H5HA基因的系统进化树(▲为2017年毒株)

2.3 HA 基因氨基酸序列分析

2017年病毒的cDNA 均包含了一个完整的开放阅读框架(ORF),编码区长1701,共编码566个氨基酸(aa),包括信号肽( 1-16aa) ,HA1 (17-343aa),HA2 (345-566aa)和1个精氨酸(344aa)。2016年以前的毒株则在HA1多1个氨基酸。

2.4 糖基化位点与裂解位点的分析

氨基酸序列分析结果表明,2016年以前的毒株HA基因的潜在糖基化位点有7个,分别位于 26-28、27-29、39-41、 181-183 、302-304、500-502、559-600位aa位点上,位点1-5位于HA1,位点6-7位于HA2。2017年毒株潜在糖基化位点增加至8个,在140-142位增加了1个位点,主要是由于2017年毒株发生142位E缺失后产生,这是近期毒株的重要变异之一。裂解位点方面,各毒株呈现强毒的分子特征,PLRERRRK/RGLF,碱性氨基酸较A/Goose/Guangdong/1/96株少1个,详见表1。

表1 潜在糖基化位点分析


注:序号2-8为参考毒株。有下划线的为新增的位点。

2.5 受体结合位点分析

HA蛋白的受体结合位点(Receptor Binding Site,RBS)是病毒感染识别和结合细胞受体的部位,HA三聚体的每1个单体都具有1个RBS,包括口袋左缘236-240位(NGQSG),口袋右缘145-149位(SGVSS)、口袋底部107位Y和165位W、口袋后壁202位E和206位L。本研究中2.3.4.4毒株的受体结合位点的较一致,但从2016年的毒株开始,在口右缘发生了L145S的变异,这可能导致宿主范围和抗原性发生改变。238位(H3排序226位)匀为Q,保持禽源毒株的特征。2017年以后的毒株另有12个位点发生了较一致的变异,主要集中在HA1肽段,其中142位E出现了缺失是一个重要的特征。56、131、139和145位较之前2.3.4.4分支的毒株发生了变异,但与H5亚型流感的祖先毒株A/Goose/Guangdong/1/96株一致,呈现出返祖的现象,推测其抗原性较早前的毒株更为接近。详见表2。

上一篇:塞尼卡谷病毒重组酶聚合酶扩增技术(RPA)实时荧光检测方法的建立

下一篇:我国部分猪场猪圆环病毒3型流行病学调查

网站地图 | 服务条款 | 联系方式 | 关于阳光
冀公网安备 13050002001403号

|

建议使用1440*900分辨率浏览 
冀ICP备14003538号  |   QQ:472413691  |  电话:0319—3163003  |