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山东地区新型鸭呼肠孤病毒的分离与鉴定

时间:2018-12-26    点击: 次    来源:阳光畜牧网    作者:高绪慧 - 小 + 大

摘要:为了解山东地区肉鸭呼肠孤病毒的流行情况,本研究从山东地区收集肉鸭坏死脾脏病料,经研磨处理,接种鸭胚,对分离病毒进行PCR扩增和σC基因测序分析。PCR扩增结果显示共分离得到6株病毒,测序结果显示,6株病毒σC基因核苷酸同源性为99.0-100.0%,与新型呼肠孤病毒毒株核苷酸同源性为93.7-99.3%。由此确定,分离的6株病毒均为新型呼肠孤病毒(Novel duck reovirus, NDRV)。该研究为山东地区NDRV的防控提供一定参考依据。

自2005年以来,在广东、四川、福建、浙江、安徽等省份陆续报道雏番鸭、雏半番鸭、麻鸭群中出现一种新的病毒病,以肝脏和脾脏不规则坏死、出血为主要特征,给当地水禽养殖业造成重大损失,经病毒分离鉴定为新型呼肠孤病毒(NDRV)。2006年刘红等首次从北京鸭脾坏死病料中分离到一株NDRV,随后,陆续从番鸭、北京鸭、鹅等水禽中分离到NDRV[3-8]。NDRV同番鸭呼肠孤病毒(Muscovy duck reovirus,MDRV)均属于正呼肠孤病毒属,但不同于MDRV的是其感染宿主的范围更广,主要以脾出血、坏死为典型症状,且阻碍雏鸭生长,现已成为危害养鸭业重要传染病之一[9,10]。

为了解山东地区肉鸭呼肠孤病毒的流行情况,本研究从山东省不同地区发病鸭中收集到6份病料,通过鸭胚分离得到6株病毒,经PCR扩增、克隆测序证实,该病毒是NDRV。

一.材料和方法

1.1材料

1.1.1病料来源和鸭胚

病料来自2017年12月至2018年3月份山东菏泽、临沂、潍坊等地区部分肉种鸭和商品肉鸭养殖场饲养的发病雏鸭。6日龄鸭胚由山东省某孵化场提供。

1.1.2仪器和试剂

PCR仪购自Bio-Rad公司;全自动核算自动提取仪购自Thermo公司;磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒购自TIANGEN公司;DNA凝胶回收试剂盒、质粒微量提取试剂盒购自AxyGen公司;10 mM dNTP Mixture, Random Primer, Recombinant RNase Inhibitor, M-MLV, Premix Ex Taq, DL2000 DNA Marker, pMD19-T Vector, E.coli DH5α Electro-Cells均购自宝日医生物技术(北京)有限公司。

1.2方法

1.2.1病料的PCR检测

参照文献[11]取脾脏加入3倍体积生理盐水,低温研磨,取两支1.5 mL EP管各取1 mL研磨液,反复冻融3次,8000 r/m离心10 min,保存上清液。取200 μL上清液,用磁珠法DNA/RNA核酸共提试剂盒按其操作说明书,用全自动核酸提取仪提取核酸,用50 μL DEPC水洗脱即得DNA和总RNA,进行RT反应,得cDNA。

参照文献[1],根据GenBank上公布的NDRV S1基因序列,利用Primer Premier 6.0设计一对扩增片段大小为373 bp的特异性鉴定引物,由上海生物工程有限公司合成。对获得的cDNA和DNA,用本实验室自行设计的新型鸭呼肠孤病毒(NDRV)鉴定引物和本实验室已验证的鸭瘟病毒(DPV)引物[12]、农业行业标准(NYT772-2013)禽流感(AIV)M基因检测引物、鸭肝炎病毒(DHV)检测引物[13]、鸭细小病毒(GPV)检测引物[14]、番鸭呼肠孤病毒(MDRV)检测[15]分别进行PCR检测。

1.2.2病毒的分离

取上述上清液,0.22 μm 滤器过滤,每份按0.1 mL/胚经卵黄囊接种3枚6日龄鸭胚,弃去24 h内死亡鸭胚,传1至3代。

1.2.3病毒σC基因的扩增和序列分析

收集病毒尿囊液各取200μL,按上述方法提取核酸并进行反转录,得cDNA。参照文献[16]根据GenBank上公布的NDRVS1基因序列,利用Primer Premier 6.0设计一对测序引物,RT-PCR扩增包含完整σC基因的一段长997bp的序列。用NDRV的σC基因测序引物进行PCR扩增。将σC基因扩增产物进行回收、连接并转化,筛选阳性进行质粒提取,鉴定后送上海生工测序。

二.结果

2.1发病鸭的症状和剖检变化

发病雏鸭出现零星死亡,个体偏小,剖检变化以脾脏坏死为主要特征。发病日龄均在3-15日龄,鸭群早期无明显特异性症状,零星死亡,有的鸭群持续到30d,死亡率在6-12%左右,后期鸭群体重不均匀。剖检变化以脾脏出血和坏死为主要特征。

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