时间:2020-05-14 点击: 次 来源:中国动物检疫 作者:黎军,刘倩等 - 小 + 大
1.2 主要试剂 DL 2 000 DNA Marker、2×Taq PCR MasterMix、反转录试剂(PrimeScript RT reagent Kit),均为大连宝生物工程有限公司产品;病毒基因组DNA/RNA 快速抽提试剂盒,为 Axygen 生物科技有限公司产品。 1.3 引物设计与合成 根据GenBank中公开发表的各病毒基因序列,利用 Meg Align(DNAstar)、Primer Premier 7.0 软件设计引物,并由生工生物工程(上海)服务有限公司合成。引物信息见表 2。 表2 5 种病毒的引物信息
1.4 病料处理及病毒 DNA/RNA 提取 取适量病死猪病料(脑、肺、脾、肾、淋巴结和小肠等)放于研磨器中,按质量比 1:5 加入灭菌生理盐水,在组织研磨器内进行研磨使其呈糊状,然后移入灭菌 EP 管中,反复冻融 3 次,4 ℃条件下 10 000 r/min 离心 5 min,取上清进行 DNA/RNA抽提或保存于 -70 ℃ 冰 箱 备 用。 按 照 AxyPrepBody Fluid Viral DNA/RNA Miniprep Kit 使用说明书,对样品上清进行 DNA/RNA 提取,对所获得的 DNA/RNA 直接进行 PCR/RT-PCR 或置于 -70 ℃保存。 1.5 病毒目的基因片段扩增 1.5.1 CSFV、PRRSV 和 PEDV 的 RT-PCR 检测 利用特异性引物,对提取的样品 RNA 进行RT-PCR 扩增。反转录体系 10 µL:RNA 模板 7 μL,5×Prime-ScriptTM 缓冲液 2 μL,RT Enzyme Mix0.5 μL,下游引物 0.5 μL。反转录条件:42 ℃40 min,94 ℃ 5 min,反应产物于 -20 ℃保存备用。 PCR 扩增体系 25 μL:2×Taq PCR Master Mix12.5 μL,上、下游引物各0.5 μL,反转录产物(cDNA)3 μL,ddH2O 8.5 μL。PCR 扩增反应条件:94 ℃预变性 5 min;94 ℃变性 30 s,按表 2 退火温度退火30 s,72 ℃延伸 45 s,共 35 个循环;72 ℃延伸10 min。反应结束后取 10 μL PCR 扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,然后在凝胶成像系统上观察。 1.5.2 PCV2 和 PRV 的 PCR 检测 利用特异性引物,对提取的样品 DNA 进行 PCR 扩增,PCR 扩增体系同 1.5.1。PCV2 的 PCR 扩增反应条件:94 ℃预变性 5 min;94 ℃变性 40 s,按表 2 退火温度退火 40 s,72 ℃延伸 70 s,共 35 个循环;72 ℃延伸 10 min。PRV 的 PCR 扩增反应条件:94 ℃预变性 5 min;94 ℃变性 30 s,按表 2 退火温度退火 30 s,72 ℃延伸 45 s,共 35 个循环;72 ℃延伸 10 min。 1.6 数据处理与分析 利用广西兽医研究所病毒室建立的 PCR/RTPCR检测方法,对采自14个地级市的2 104份样品,分别进行 CSFV、PRRSV、PRV、PCV2、PEDV 5种病原检测,并分析病原的混合感染情况及其地区和季节分布特点。同一份样品同时检测到 2 种病原归为二重感染,同时检测到 3 种病原归为三重感染,依次类推。使用 SPSS 19.0 软件,分析 5 种病原感染的显著性差异。 2 结果与分析 2.1 RT-PCR/PCR 检测 上述 5 种病原经特异性引物扩增,PCR 产物电泳后,在紫外线光下可观察到大小分别为 288 bp(CSFV)、738 bp(PRRSV)、1 154 bp(PCV2)、217 bp(PRV)和492 bp(PEDV)的目的条带(图1),分别与预期片段大小相符,表明本试验设计的引物特异性强。 |
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