牛结节性皮肤病的流行新动态及我国的应对策略

2.2.2 LSD在印度的流行情况与毒株鉴定

2019年8月印度首次报告在奥里萨邦的5个地区牛中发生了LSD疫情，其中2539头牛中有182头被感染，对60头LSD疑似牛和17头无症状接触牛的102份样本进行检测，LSDV实时PCR阳性率为37.66%。在病牛中，结痂（79.16%）中LSDV基因组的检出率高于血液（31.81%）和冷冻精液（20.45%）。基于部分P32（LSDV074）和F（LSDV117）基因序列以及完整的RPO30（LSDV036）基因序列的遗传演化分析表明，5株印度LSDV毒株均与全球流行的其他田间毒株相同并聚在一起。然而，F和RPO30基因序列分析显示，印度LSDV毒株在遗传上比欧洲毒株更接近南非NI2490/KSGP样毒株，现研究确定LSDV田间毒株与印度疫情的暴发有关，但它是由何处传播而来，仍不清楚。

虽然现在无法确定LSDV在印度的起源和来源，但LSD最有可能的方式是感染动物未被控制或非法流动而传入。LSDV感染牛的流动被认为是引入该病的主要来源，特别是能更快、更远地传播到的其他地区。尽管这一推测没有官方的数据佐证，但不能完全排除活牛通过印度-孟加拉国边境的非法贸易。第二种可能性是，LSD发生在中国、孟加拉国和印度的邻近地区，但仍未被发现和证实。第三种可能性是，LSD通过风或车辆运输在邻国之间传播，如通过成群的吸血昆虫媒介传播。

2.2.3 LSD在孟加拉国的流行情况与毒株鉴定

2019年9月15日孟加拉国向OIE通报了首次暴发的LSD疫情。该病于2019年7月在该国东南部的吉大港市（Chattogram）开始，然后逐渐蔓延到全国各地，是影响该国经济的最重要的新发病。孟加拉国不同地区（Chottogram、Dhaka、Gazipur、Narayanganj、Pabna和Satkhira）的所有受感染牛均表现出典型的LSD临床症状。对分离的孟加拉国LSDV毒株，基于全长RPO30和GPCR基因以及部分EEV糖蛋白基因序列的分子特性分析发现，孟加拉国分离株不同于在非洲、欧洲和中东地区暴发的常见的LSDV田间分离株，以及在俄罗斯和中国新出现的LSDV变异株，相反它与LSDVKSGP-0240、LSDVNI2490和LSDVKenya密切相关，似乎这与另一类疫苗株关系密切，这表明在孟加拉国持续监测和鉴定流行毒株的重要性，以及进一步区分疫苗毒株与田间病毒的必要性和复杂性。

2.3 LSD在非洲的流行情况及回顾性研究 

牛结节病最早发生在非洲，现已几乎流行到整个非洲大陆，对养牛产业产生了巨大经济影响。自2012年以来，LSDV迅速传播到非洲以外的包括中东、东欧和亚洲的新的地理区域，已成为一种重要的复杂的流行性传染病。基于在俄罗斯、孟加拉国和中国的新的流行情况，对起源于非洲大陆的病毒株的追溯研究中，也获得了一些新发现，这对认识LSDV的重组和遗传演化提供了新的线索。

2.3.1 LSD在东非地区国家的流行情况与毒株鉴定

为了解东非地区国家LSDV的遗传多样性，对传入中东地区和欧洲之前的收集于埃塞俄比亚、肯尼亚和苏丹的22份LSDV存档样本进行追溯性研究，基于RPO30和GPCR基因测序分析发现，1950年至2012年期间的东非田间分离株间以及与之前的LSDV田间分离株间非常相似，也与包括中东地区和欧洲其他地方的LSDV田间分离株高度相似。只有在肯尼亚收集的一种田间毒株LSDV Embu/B338/2011，具有与LSDV Neethling疫苗毒株和田间分离株之间的混合特征。而且LSDV Embu/B338/2011毒株与LSDV Neethling和KS-1疫苗毒株都具有相同的12个核苷酸插入序列。这与之前的多个历史分离株如LSDV Neethling疫苗LW-1959（AF409138）、LSDV RSA/54 Haden（FJ869376）、LSDV NI-2490（AF325528）、LSDV Kenya（MN072619）、孟加拉国的LSDV分离株以及俄罗斯的LSDV田间重组毒株的特征一致，但这与在乌干达2017—2018年流行的LSDV田间毒株的分子特征不一致。进一步分析其部分EEV糖蛋白、B22R、RNA解螺旋酶、病毒体核心蛋白、NTPase和N1R/p28样蛋白基因，发现LSDVEmbu/B338/2011毒株不同于之前描述的在GPCR基因中插入12个核苷酸的LSDV突变体毒株，这些发现揭示了持续监测所有LSDV分离株的遗传变异的重要性和必要性。

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