我国部分地区Sicinivirus流行病学调查

摘要：Sicinivirus是一种禽类新发病毒，可引起家禽发育迟缓综合症、腹泻、吸收不良综合征等。目前，仅部分国家开展了该病毒的流行病学调查，研究数据极为有限。为明确该病毒在我国的流行情况，以及该病毒感染率与地域、宿主、养殖方式之间的关系，2019年下半年在江苏、广西、河北、安徽、广东、上海、湖北和江西8个省（自治区、直辖市），采集25个场点1 920份家禽咽喉/泄殖腔双拭子样品，采用RT-PCR方法进行Sicinivirus检测和基因测序分析。采样场点涉及农贸市场、批发市场、屠宰场和养殖场，样品来自鸡、鸭、鹅以及鸽和鹧鸪等不同禽类。结果显示：25个场点中有13个检出阳性，检出阳性样品134份，个体阳性率为6.97%（134/1 920）。其中，河北、湖北、上海、广东、江苏、江西、广西和安徽的个体阳性率分别为24.16%（58/240）、10.83%（24/240）、5.83%（14/240）、5.41%（13/240）、4.16%（10/240）、2.50%（6/240）、1.66%（4/240）和1.25%（3/240），鸡、鹅和鸽的个体阳性率分别为10.81%（132/1 221）、2.44%（1/41）和0.42%（1/235），鸭和鹧鸪中未检测到Sicinivirus。农贸市场、批发市场和屠宰场的个体阳性率分别为3.00%（18/600）、6.23%（58/930）和24.16%（58/240），养殖场中未检测到Sicinivirus。结果表明，鸡是该病毒主要的易感宿主，不同类型场点感染率差别较大，表明家禽养殖环境与该病毒的感染有较大的关系。

Sicinivirus 是一种禽类新发病毒，为单股正向 RNA 病毒。在国际病毒学分类委员会第十次病毒分类报告（2017 年）中，Sicinivirus 被分类为微 RNA 病毒科的一个新属，目前仅有 1 个“种”（species）， 即 Sicinivirus A。根据基因序列将其分为 5 个基因型，Sicinivirus A1—A5，缩写为siv-A1—A5。

目前 Sicinivirus 的致病性和致病机理尚不清楚。有研究认为其可能是肠道中一种常在病毒，也有研究推测该病毒可能和其他肠道病毒共感染导致并发症，可能与鸡的发育迟缓综合征（RSS）、腹泻和吸收不良综合征（MAS）有关。肉鸡传染性发育迟缓综合征（infectious stunting syndrome，ISS）早在 1949 年就有报道，20 世纪 70 年代后期呈全球性发生，波及许多国家和地区，临床研究以及人工感染试验均证实该病具有传染性。

2014 年，Sicinivirus 在爱尔兰首次被发现，现世界各地都有检出该病毒的报道，如爱尔兰、中国、英国、匈牙利、巴西都检测到了该病毒。Bullman等对爱尔兰一家商品鸡肉加工场采集的 30 份鸡泄殖腔样品进行检测，发现 Sicinivirus 阳性率为 73%。Zhou 等对江苏省盐城市的商品鸡场进行检测，发现 3 个养殖场的 17 份鸡粪便样品均为Sicinivirus 阳性，虽然样品量较少，但如此高的阳性率表明该地区商品鸡场中可能存在广泛的感染。此外，利用高通量测序技术，在中国香港、英国、匈牙利和巴西的鸡中也检到了该病毒。

目前，Sicinivirus 的研究还处于初级阶段，仅部分国家进行了该病毒检测，研究数据极为有限。该病毒在我国的流行情况尚不明晰。本研究对我国部分地区进行了 Sicinivirus 流行病学调查，并分析了其感染率与地域、宿主、场户类型之间的关系。

1　材料与方法

1.1　样品采集

2019年下半年，分别在江苏、广西、河北、安徽、广东、上海、湖北和江西等 8 个省（自治区、直辖市），随机选择 25 个场点，采集 240 份家禽咽喉 /泄殖腔双拭子样品，将同一只家禽的泄殖腔拭子和咽喉拭子合并作为 1 份样品保存。共采集 1 920 份样品，其中鸡、鸭、鹅、鸽、鹧鸪的咽喉 / 泄殖腔双拭子样品分别为 1 221、419、40、235 和 5 份。

采样场点涉及 15 个农贸市场、7 个批发市场、1 个屠宰场和 2 个养殖场。咽喉 / 泄殖腔双拭子样品放置在装有 PBS- 甘油采样液的离心管中，将存有样品的离心管置于管架并编号，保持直立状态置于放有冰袋的泡沫保温盒中运输，-80 ℃保存。

1.2　主要试剂

QIAxtractor 高通量 核酸提取仪（cadorPathogen 96 QIA cube HT kit），购自德国 Qiagen公 司；PathAmp FluA Reagent Kit、Ion XpressPlus Fragment Library Kit、Ion PGM Template OT2200 Kit、Ion PGM Sequencing 200 Kit V2、E-GelSizeSelect 2% Agarose、Ion 318 Chip Kit V2、Dynabeads MyOne Streptavidin C1 Beads、IonXpress Batcode Aaptors、Qubit 核酸浓度测定仪配套试剂，均购自 Life technologies 公司。

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