蛋白质营养方面，新的合成氨基酸由于其生产价格具有竞争力，将逐渐实现商业化。除了降低饲料成本外，还会减少环境中氮的排放。继苏氨酸之后，对下一个限制性氨基酸的研究尤为重要，需要对其需求量进行评价，不仅仅是相对于赖氨酸的需要量，还要注意其在肉鸡生产中的最小摄取量及影响。比如，经证实缬氨酸对肉鸡生产有益，目前也已在实际生产中得以应用。
通常，能量是家禽日粮中最贵的营养成分。因此，较高的能量利用率可降低饲料成本。饲料配方设计时不仅要关注饲料的代谢能更要注意净能(代谢能减去因热增耗造成的能量损失，也就是有效用于生产的能量),这种策略有助于减少饲料成本和养分排泄量。
对微量矿物质的利用需要更好地理解它们与免疫系统之间的相互作用，及其来源的质量，防止残留物污染最终产品。此外，进一步研究有机和无机来源之间的差异也同样重要。
5、肠道健康
5.1 添加剂的使用
根据消费者需求及对营养与肠道健康相互作用的最新理解，抗菌剂已被禁止作为促生长剂使用。因此，营养学家需依据肠道菌群和免疫系统对常规方法进行改进，采用营养措施调节肠道菌群和免疫系统，而非使用治疗性化合物来控制肠道疾病。此外，遵守相关的畜禽健康管理条例和农场生物安全的建议将会越来越重要。目前，市场上可供利用的营养产品有酸化剂、益生素、益生菌、精油、酶制剂、渗透压调节剂、核苷酸、氧化锌等。
5.2 胚胎期的营养
由于遗传改良和上市时间缩短，肉鸡胚胎期占其生命周期的50%.因此，为保证供给家禽适量的水和饲料，胚胎期的营养管理将变得越来越重要。研究表明，在雏鸡饲养初期禁止采食或饮水，将导致肠黏膜受损。另有试验证明，肉鸡孵出后立即供给能量和营养，能加快肠道的生长发育，促进其生长。在此期间，尤其应注意供给特殊营养和制定具体管理措施，而且预饲日粮也需大量增加。另外一种技术--胚胎饲养技术，正被广泛采用，即在孵化后期将营养物质注射到胚胎中，出雏前就能促进小肠黏膜的发育和成熟。Foye等[5]发现，进行胚胎饲养的雏鸡体内有较高浓度的消化酶。Kornasio等研究表明，由于肌卫星细胞营养的影响，胚胎饲养的雏鸡会产生较多的胸肌。
6、饲料加工
从饲料厂结构来看，在不久的将来，动物蛋白行业至少要面临两个挑战：
第一个挑战是各国采用的监管制度不同，但都期望实现产品的可追溯性和生产的可持续性。在2005年，欧盟国家建立了监管制度183/2005/CE,并决定在2006年年初实施。其主要目标与动物饲料卫生相关，保证动物饲料和人类食品的安全。这样的监管制度激励了其他国家，特别是肉制品出口国，他们开始在饲料厂实施GMP(优质食品规范).所有这些新制度，都要求在饲料厂结构中进行投资和建立良好的数据库信息，保存消费者对最终产品的可追溯性信息。
第二个挑战则源自对原料概念的理解差异。到目前为止，贸易商主要将玉米和大豆作为商品出售，最终的营养组成不是影响贸易的重要因素。在将来，如果饲料继续占据至少70%的生产成本，基于成本的考虑，这种过分简单化的交易方式将无法再被采用。所以，如果要达到精确的营养理念，就需要更认真考虑营养成分的变化，这些变化可由植物品种、加工、收获时间、营养密度、有无霉菌毒素等引起。Zhou等[7]研究发现，淀粉酶对淀粉的消化率是决定玉米代谢能的主要因素之一，可用于预测家禽的有效能值。Li等[8]的研究显示，可通过基因工程改善玉米营养品质，培育低植酸品种。对来自马来西亚、美国和阿根廷的大豆进行研究发现，样本间的表观代谢能有显着性差异，能影响肉鸡生产性能。因此，一些饲料原料不再被单纯地视为商品，当人们决定购买时，会考虑其定性和定量方面的因素。同时，为了协调成分之间的差异，必须在饲料厂采用隔离保存的措施。这就需要根据成分的营养特点，分不同批次放在仓库中贮存。除了放在仓库外，对于玉米和一些谷物，饲料厂还需要配备清洗装置。重力分离器是一种常用的工具，可根据原料密度进行分离。然而，如果实施成分的分离仅限于湿化学技术，往往是非常昂贵且耗时的。而利用近红外光分析仪(NIRS)可以克服这种限制，可对每一批次的能量、氨基酸成分和消化率进行即时分析。所以，新饲料厂的设计需要考虑利用NIRS,使得仓储、配量和搅拌更具灵活性，可以减少目前由于基础设施缺乏导致的原料浪费。
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