4、无论是 H5 还是 H9 亚型禽流感病毒都在不断发生抗原变异，增加了疫苗防治的难度
遗传和变异是任何一种生物的基本特性；尤其在不良环境压力下，更会促进其变异，如抗体的压力会导致病毒抗原性的改变。在我国，应用 H9N2 亚型禽流感疫苗已至少有 10 年的历史，而目前流行的 H9 亚型禽流感病毒至少有 3 组不同类型的抗原群，不同抗原组之间交叉反应性较差；而 H5 亚型流感疫苗的应用也有一定时间，依据现有的报道资料，我国广西、云南、江西以及湖南等地的高致病性禽流感血凝素抗原性都存在较大的差别，而且动物实验表明，对鸭接种的病毒，后期所排放的病毒与原接种病毒相比就有数量不等氨基酸的差异，充分说明了 H5 亚型禽流感病毒抗原容易发生变异，而且禽流感病毒抗原变异似乎进入了一个活跃期。因此，禽流感病毒抗原性的改变，无论是对动物还是对人类疫苗免疫防控都造成了很大的困难。
5、禽流感病毒的毒力和致病性越来越强
禽流感病毒的致病力越来越强，主要体现在以下三个方面：第一，以往认为水禽对禽流感病毒具有很强的抵抗力，但目前现实告诉我们，所有的水禽，无论是家养水禽还是野生水禽都可以感染发病与死亡。第二，从对实验动物的致死时间来看，早期的分离株，对实验动物鸡或小白鼠的致死时间比目前的分离株时间要长，目前的分离株可以在很短的时间致死鸡（小于 24 小时）或小白鼠（小于 72 小时）。第三，对实验动物脏器组织的亲嗜性而言，早期的分离株分离株在小白鼠的少数脏器繁殖，而当前的分离株可能会在全身各脏器繁殖，从而造成动物严重的脏器病变，加速动物的死亡。
6、双向传播和基因重排使得病毒的生物学特性越来越复杂
如上所述，水禽尤其野生迁徙水禽是禽流感病毒的自然贮存宿主，禽流感病毒在其自然宿主中的进化几乎是静止的，但禽流感病毒的生态学和分子流行病学调查表明，一旦从水禽 传播到家禽或陆基禽，即改变宿主后 ，其进化和变异速度大大加快，而这些变异的病毒不仅对家禽造成发病与死亡，而且由于野禽 --- 家养水禽 --- 家禽的相互接触机会很大，病毒又从家养禽类反向传播给水禽和野生水禽，从而形成禽流感病毒的双向传播。病毒不断在不同宿主之间的交互传播，大大增加了病毒基因重排的几率，目前发表的有关禽流感病毒的大量分子流行病学资料充分证明了这一点。双向传播不仅可使病毒的致病力不断增强，而且使得病毒可感染宿主的范围加大，并且使我们对病毒生物学特性的改变越来越难以预测。
二、我国未来控制方略
我国在禽流感的防控中取得了令世人瞩目的成绩，一次又一次成功打赢了禽流感阻击战，但我们必须清醒地认识到，禽流感在短期内难以根本消除，并且我国不少地方兽医机构和队伍不健全，防疫体系薄弱，养殖方式落后等 因素也决定了禽流感防控任务依然艰巨。在禽流感的防控方面，各级部门以及养殖企业单位都业已制定了多种措施，并在生产上发挥了重要作用。这里，作者从宏观总体控制及养殖场个体防治两个层面谈一谈禽流感防控的相关问题，与大家商榷。
在宏观方面：
1 、尽快启动禽流感区域性参考实验室的建设
在高致病性禽流感的防控中，关键是要早发现、早确诊、早处理，及时将其控制和扑灭，防止疫情扩散，使损失降低到最低程度。我国幅员辽阔，在某些偏远地区，交通仍欠发达，一旦某个地方发生动物疫病死亡，然后将材料运送到地处我国东北的国家禽流感参考实验室，则需要花费较长时间，如果某个环节工作不到位，则禽流感很容易传播开来。因此，为了缩短禽流感的确诊时间，减少在确诊前，疫情从疫点散播开来的危险性，建立“区域性禽流感参考实验室”，必须要提到日程上来。
2 、加快 BSL-3 实验室的验收工作并加强禽流感相关基础研究
由于高致病性禽流感是关系到国计民生的重大动物疫病，对人健康具有很大威胁，因此，保证研究的安全性具有重要的意义。目前我国不少科研院所都建立了 BSL-3 实验室，可以说具备研究禽流感病毒的硬件。但在对 BSL-3 实验室的验收与管理方面，目前由于种种原因，时值今日，我国通过验收的 BSL-3 实验室，寥寥无几，这种局面严重阻碍了禽流感科研工作的顺利进行。我们必须清楚地认识到我们国家在禽流感的基础研究方面与国外的巨大差距，决不能因为 BSL-3 实验室的建设与验收等因素阻碍科研的进行。重大传染病的科研水平也是防控水平的体现，因为科学防控必须有科学的数据和依据。
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