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1998年以来，为加强动物防疫基础设施建设，国家每年投入数亿元，在全国实施了动物保护工程。先后在6省份部分地区建设了无规定动物疫病区示范区，初步实现了疫病的区域化管理；建设动物防疫、冷链体系以及在12个畜牧主产省的动物防疫基础设施建设，基本解决了市、县级防疫基础设施薄弱的问题；动物疫病国家级实验室和外来病跟踪检测实验室已经建成；全国已建成304个国家级疫情测报站，146个边境动物疫情监测站。目前，已有2800多个县级动物防疫检测机构实现了与国家动物疫情传报网络中心的连接。
在基础设施建设的带动下，一系列重大动物疫病防治规划、应急预案得以实施。动物疫病的疫情监测、预防免疫、检疫、封锁、隔离、扑杀和消毒等技术措施逐步走向制度化。下图为全国建立的国家级边境动物疫病测报站和动物疫情测报站分布图。
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