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2015—2017年我国猪繁殖与呼吸综合征流行毒株遗传变异分析

时间:2018-07-09    点击: 次    来源:吉林大学动物医学学院    作者:刘晓东等 - 小 + 大

■为疫苗毒株(作为参考毒株)

图 2 PRRSV 分离株遗传进化树

氨基酸对比发现:6 株第一亚群野毒株与代表毒株 VR2332 同源性为 92.8%~98.9%,与其他亚群同源性为 81.8%~89.3%;第四亚群 的 35 株野毒与代表毒株 TJ-F92、JXA1 等同源性为 93.1%~99.4%,与其他亚群同源性为 82.7%~95.1%;11 株第五亚群与代表毒株NADC30 同源性为 94.1%~98.9%,与其他亚群同源性为 81.3%~89.1%;新亚群 6 株野毒之间同源性为 93.2%~97.85%,与其他亚群同源性为81.6%~85.3%。

2.4 氨基酸序列进化分析

与 PRRSV GP5 相关的毒力位点为氨基酸第13 和 151 位。以 VR2332 为代表的第一亚群毒株毒力位点为 R13、R151,以 CH1R 为代表的第二亚群毒株毒力位点为 R13、R151,以 HB-2 为代表的第三亚群毒株毒力位点为 R13—Q13,以JXA1/TJ2006 为代表的第四亚群毒株毒力位点为R13、R151,以 NADC30 为代表的第五亚群毒株毒力位点为 Q13、K151。分离的第一亚群 6 株野毒株中,有 2 株(YN-1509/HeNXX-1704)的第 13位点为 Q13,其他均为 R13;第四亚群的 35 株野毒株的第 13 位点均为 R13;第五亚群 11 株野毒株的第 13 位点,除 HeB-JZ-1610 为 P13 外,其他均为 Q13;6 株新亚群野毒中,FJSM-1705 为 R13,FJ-15091/gx-15-11/gx-yl-1504 为 Q13,JX-1705/SH-1705 为 P13。6 株分离的第一亚群毒株氨基酸 151位 点 中,HENXX 为 G151,其他为 R151;第四亚群中,11 株为 R151,其他为 K151;分离的 11株第五亚群毒株中,FJZZ-1609 为 R151,其他为K151;分离的 6 株新亚群均为 K151。

PRRSV 氨基酸序列的中和表位是位于第37~44 位的 SH(F/L)QLIYN,其中 F/L39 为中和抗体的表达位点。以 VR2332 毒株为代表的第一亚群为 L39,以 CH1R 毒株为代表的第二亚群为 F39,以 HB-2 毒株为代表的第三亚群为 F39,以 TJ2006/JXA1、HUN4 毒株为代表的第四亚群为 I39,以NADC30 毒株为代表的第五亚群为 L39。2015—2017 年所分离的 58 株野毒株中,6 株第一亚群野毒株的中和抗体位点为 L39,35 株第四亚群野毒株中和抗体位点为 I39,11 株第五亚群中和抗体的位点为 L39,6 株新亚群中和抗体的位点为 S39。

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