畜禽肠道菌群耐药基因的研究进展

3 肠道菌群耐药基因对宿主的影响

长期使用抗生素会导致耐药基因的出现和耐药菌的增加，肠道菌群多样性降低，对宿主健康产生不利影响。值得注意的是，微生物群中并非所有的细菌都会对不同的抗生素干预有反应，不同抗生素对微生物组成和代谢的影响也可能不同。

3.1 抗生素对猪耐药性的影响

传统上，抗生素对耐药菌株出现的影响主要集中在致病性微生物，如弯曲杆菌、肠球菌、大肠杆菌和沙门氏菌，但是抗生素并不仅仅针对致病菌。Kalmokoff等[41]评估了喂食泰乐素(44、88 mg/kg)或维吉尼亚霉素(11、22 mg/kg)的猪粪便中总厌氧菌的耐药性，并记录到所有厌氧菌对这两种抗生素均具有耐药性，这可能反映了抗生素在养猪生产中使用的时间很长。大量的blaTEM-1基因（β-内酰胺酶的主要编码基因之一）导致口服或肌肉注射氨苄西林(20 mg/kg)的猪粪便中携带的细菌氨苄西林耐药性增加[42]。Agga 等[43]研究发现，猪在断奶后饲喂添加550 mg/kg 四环素和铜补充剂的饲料，粪便中tet(a)基因丰度较高，但tet(B)基因的丰度不受影响。使用抗生素的猪肠道菌群对长期变化的适应能力是明显的。与幼猪相比，老年猪的肠道菌群对饲料内抗生素的反应似乎更少。生长早期也是抗生素提高饲料效率和生长速度最有效的时期。

3.2 抗生素对牛耐药性的影响

与人类和试验动物模型不同，关于抗生素对牛微生物群/抗性组影响的信息有限。然而，许多研究描述了抗生素的治疗性和亚治疗性给药对牛特定细菌病患病率的影响。这些研究通常涉及对照动物给予抗生素，然后对感兴趣的微生物进行培养以进行药敏试验。用高通量测序和功能性AMR 基因注释（表1），很少有研究使用高分辨率测序方法描述抗生素对牛微生物种群多样性的影响。

3.3 抗生素对禽类耐药性的影响

宋毅等[48]对山东部分鸭源大肠杆菌耐药性进行分析，发现鸭源大肠杆菌耐药严重，并且携带有多种耐药基因。近年来，肺炎克雷伯菌的耐药性不断增加，我国已成为多重耐药肺炎克雷伯菌的流行地区。严钰璋等[49]对甘宁地区蛋鸡进行研究，发现肺炎克雷伯菌多重耐药情况严重，耐药基因丰富。Li等[50]对山东肉鸡抗生素敏感性进行研究，结果显示87.88%的分离株具有多重耐药性，而Yang 等[51]进行的河南家禽的敏感性试验结果显示，88.9%的分离株有多重耐药性。以上结果凸显了抗生素治疗面临的挑战以及耐药基因传播的风险，提示对抗生素需要合理使用以降低细菌耐药性问题。

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