时间:2019-04-14 点击: 次 来源:中农威特公司 作者:孙彩琴 - 小 + 大
2. 实时荧光定量PCR(RT-PCR) 实时荧光定量PCR是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进行实时监测。相比常规PCR方法,实时荧光定量更加快速,灵敏,减少交叉污染以及能够对监测结果进行定量。而且,实时荧光定量PCR可以使用96孔板,更加高效与自动化。目前已经有便携式的实时荧光定量设备,这将给未来的临床诊断带来根本性的改变。 King等首次报道的TaqMan实时荧光PCR详细步骤已收集在OIE手册中(OIE,2012)。该试验方法很敏感且又特异,可以检测到10到100个病毒基因的拷贝数。这个方法在25种不同非洲猪瘟病毒株以及非洲和欧洲16种蜱分离毒株中得以验证,而且与其它猪病没有交叉反应。Zsak等研究的另外一种基于VP72的TaqMan实时荧光PCR可便携的仪器,因此简化了试验前后的步骤。同时,这个方法有非常高的敏感性与特异性。与前一种方法相比,它可以检测到1.4到8.4个病毒基因的拷贝数。第三种实时荧光定量PCR是Mckillen等利用DNA双螺旋上的小沟(MGB)结合物探针来扩增非洲猪瘟病毒的9GL基因,它可以检测到至少20个病毒基因拷贝数,这种方法已经在15种非洲猪瘟病毒株以及相似猪病得以验证。目前由包括兰州兽医研究所等多家单位共同起草、由中国兽医协会发布的T/CVMA5-2018非洲猪瘟病毒实时荧光PCR检测方法在我国非洲猪瘟病毒检测中发挥重要作用。 3. 多重PCR Felicity等已经建立了多重实时荧光定量PCR方法来同时检测和区分非洲猪瘟和猪瘟病毒。它的敏感性对两种病毒都达到了100%,它的特异性对猪瘟是100%,而对非洲猪瘟是97.3%。常规多重PCR可以同时检测出多种猪源病毒,该方法使用多对针对各自病毒的不同引物,因为可以扩增出不同条带的片段,因此可以在琼脂糖凝胶电泳中加以区分。虽然,它的敏感性比单一常规PCR降低10倍左右,但是,可以同时检测出多种猪源病毒。 4. 等温扩增反应 虽然RT-PCR方法在检测非洲猪瘟病毒时的敏感性和特异性都很高,但因为这些方法都需要比较昂贵的实验设备。等温扩增试验就为了基层等条件较为落后的实验室提供了一种选择。等温扩增技术检测非洲猪瘟病毒是一种非常有效的实验室检测手段。相比较其他方法,等温扩增试验只需要一个恒温水浴锅,不需要昂贵的热循环设备。其中一种等温扩增方法是基于环介导等温扩增反应(LAMP)原理建立的检测方法,通过检测38种不同的非洲猪瘟病毒株来比较该方法与其他检测方法。结果显示,它可以检测出330个病毒基因拷贝数,敏感性低于其他试验方法。但是,对检测非洲猪瘟致死的猪群,这种方法的敏感性也很高。 四、RT-PCR、LAMP和抗原ELISA 检测方法比较试验 OIE参考实验室IAH-Pirbright通过试验比较了一种实时荧光定量PCR,一种商品化的抗原ELISA和一种LAMP方法。实验样品选自试验感染动物和疑似自然感染动物。对于试验感染动物,使用非洲猪瘟毒株(OURT88/1)攻毒感染后5天收集样品进行检测。RT-PCR和LAMP试验方法检测全部18头份都是阳性,RT-PCR的Ct值都比较低,表明了试验动物病毒DNA的拷贝数很高,LAMP试验方法在不到30分钟检测出所有阳性。抗原ELISA的检测结果发现只有14头份动物是阳性,3头份不确定,还有一头份是阴性。阴性动物对所有方法的检测都是阴性。这个结果表明了RT-PCR和LAMP在检测非洲猪瘟急性症状样品时的敏感性要好于抗原ELISA。田间样品选自2004到2009年来自加纳疑似感染非洲猪瘟病毒动物。在所有46份样品中,RT-PCR检测34份是阳性,LAMP检测33份是阳性。唯一的一份LAMP检测是阴性,但它的RT-PCR的Ct值也非常高。当LAMP的Tp值调到40时,它的敏感性就和RT-PCR一样了,这表明了Tp值在LAMP试验中的重要性。而将这些样品用于抗原ELISA时,只有14份是阳性,10份不确定性,22份是阴性。这个结果表明了抗原ELISA的敏感性要远远低于RT-PCR和LAMP方法,这可能是由于田间样品的纯度造成的。虽然抗原ELISA比RT-PCR和LAMP的敏感性都低,但当临床检测紧急爆发非洲猪瘟时,抗原ELISA还是能够成功检测出非洲猪瘟病毒。 五、结语与展望 综上所述,目前可用于非洲猪瘟病毒检测的诊断技术有病毒检测和抗体检测,本文主要介绍了病毒检测的方法。实时荧光PCR是最为广泛、有效的病毒学诊断技术,敏感、特异、快速并且高通量地实现非洲猪瘟病毒的检测。由于存在交叉污染的可能,应采取其他检测方法比对,并且结合血清学、病理学和流行病学调查的结果综合诊断。另外,由于PCR所检测到的阳性仅仅是病毒核酸阳性,因此,除PCR之外,在新的疑似感染地区报告疫情前,建议先从疑似样品中分离获得病毒才能确诊非洲猪瘟。 |
上一篇:实验室6S管理大全
下一篇:布鲁氏菌病实验室诊断方法研究进展
|
建议使用1440*900分辨率浏览