2、各项防控措施要同步进行，整体推进
同所有的传染病一样，口蹄疫防控的基本原则也是，消灭传染源、切断传播途径、提高动物的抵抗力。免疫预防、监测净化、流通监管、应急处置、无害化处理、检疫监督、加强动物的饲养管理，改善饲养条件、建立生物安全措施等相关措施需要同步进行。
尤其是，进行大规模的免疫接种，一定要注意疫苗及其检测毒株与流行毒株的匹配性，整体推进，提高防控工作的针对性。
由于口蹄疫病毒抵抗力较强，在自然情况下，含毒组织和污染的饲草、毛皮及土壤等可保持传染性达数周甚至数月，口蹄疫病毒“怕热不怕冷，怕干不怕湿，对酸碱敏感”，常见的生理盐水、75%酒精、乙醚、氯仿和去污剂等对口蹄疫病毒则作用不大，而且在有机物存在下，可抵抗碘伏、季铵盐和酚等消毒剂。因此消毒剂也要匹配，OIE网站显示，口蹄疫病毒可以被氢氧化钠（2%）、碳酸钠（4%）、柠檬酸（0.2%）和乙酸（2%）等灭活。
3、及时确诊，密切监视疫情新变化
要用动态的观念来进行口蹄疫的防控。变异是口蹄疫很重要的一个生物学特征。变异包括毒力、抗原性、宿主噬性的变化。往往发生大的抗原性变异以后，原有的疫苗很可能对其没有免疫保护效果，就需要及时更换制苗种毒。口蹄疫病毒有交替感染的特性，即：各血清型之间不能产生交叉免疫，感染某型病毒后的康复动物或免疫某型病毒疫苗后的动物，仍可感染其他型病毒。这一特性往往会导致误诊。
强化监测与流行病学调查。及时准确掌握病原分布和疫情动态，科学评估口蹄疫发生传播风险，及时发布预警预报。坚持抗体监测、病原学监测、流行病学调查和风险评估、跟踪病毒变异情况，分析验证疫苗毒株与流行毒株的匹配性，提出防控措施建议。
4、认真分析总结口蹄疫疫苗免疫失败的原因
畜群口蹄疫疫苗免疫后，个别情况下有出现发病和死亡的现象，这不能说明疫苗质量有问题，往往与多种因素有关。口蹄疫免疫失败的原因复杂，并非单一的产品质量决定。如环境污染，潜伏感染、隐形带毒；免疫密度不够，野毒干扰；疫苗不匹配；免疫程序不合理；疫苗的冷链运输和贮藏有问题；接种不科学，免疫质量没有保障；免疫效果评价不客观；接种应激因素的发生；疾病综合防治措施不到位等。较为常见的是，口蹄疫的群体潜伏期和病程长短不一样，如果在潜伏期注射疫苗，免疫后可能会出现发病或死猪的现象。
5、防范外来口蹄疫
目前，A-Iran-05，O-PanAsia-2和Asia1-Sindh-08等抗原变异毒株在中东地区普遍流行，我国应及早部署，建立必要的技术储备。
总之，口蹄疫的危害巨大。口蹄疫一旦暴发，能迅速演变为生物灾害，国家或地区的经济、贸易、形象受损。口蹄疫是烈性传染病，发病率几乎达100%。幼畜恶性型死亡率通常50%，有时可达100%。种畜价值丧失，奶产量平均下降40%，肉产量下降30%--40%。役用畜使役能力下降，昂贵的防疫经费。为此，我们必须要慎之又慎，科学防控。
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