免疫程序是根据疫苗的品种，合理安排使用时间和免疫剂量，最终确定下来的一套免疫方案。各个猪场由于饲养管理方式不同、采购的疫苗不同、当地的疫情不同等等因素，所采用的免疫程序也是千差万别。这些免疫程序并没有好与不好之分，适合自己的就是最好的，只要猪群稳定，抗体检测理想，免疫程序就是合理的。但是很多猪场，在选择免疫程序的时候往往会犯一些常识性的错误。现将一些可能遇到的误区简单归纳如下：
1、对疫苗的保护对象认识不清
猪用疫苗的保护对象主要包括种猪、乳猪、保育猪、育肥猪四个阶段的猪群，要根据疾病的主要威胁对象，疫苗的主要保护对象来选择免疫程序。
猪瘟、蓝耳、伪狂犬、口蹄疫，对各个阶段的猪群来说是都需要免疫的或者要有保护力；因此，猪瘟、蓝耳、伪狂犬、口蹄疫等疫苗，不仅需要保护种猪，并且还要通过种猪高水平的母源抗体来保护仔猪，因此种猪群要终身免疫，并且一般3-4个月要加强免疫一次，仔猪要根据母源抗体衰减规律进行2-3次免疫。
圆环病毒，重点保护对象是乳猪和断奶仔猪，但是乳猪以及断奶前期的保护，靠疫苗免疫来不及，所以要靠免疫母猪来获得高水平的母源抗体，仔猪通过吃初乳获得母源抗体产生被动的免疫保护，后期再通过主动免疫产生抗体，重点保护断奶后期及保育、育肥阶段。所以母猪免疫圆环疫苗，建议在产前跟胎免疫，最好不要进行一刀切。
乙脑、细小病毒等，重点保护对象是种猪，其他阶段的猪即使感染影响也不大；因此，乙脑和细小病毒疫苗主要以免疫母猪群为主。
2、对疫苗的保护时间认识不清
不同的疫苗，抗体维持时间也不同。伪狂犬的母源抗体一般能够维持到50-60天仍然100%阳性，但猪瘟的抗体可能在20-40天之间就没有保护力了，所以猪瘟首免一般在20天以后，40天前，伪狂犬除滴鼻免疫外的首免时间最好放在50天以后。如果猪瘟首免在20天前，母源抗体水平很高，会中和部分疫苗抗原，造成免疫失败。
当然母猪的不同免疫程序，也会影响仔猪的首免时间。如果母猪在产前跟胎免疫猪瘟疫苗，猪瘟的母源抗体时间可能维持的时间较长，那首免时间可以在35天左右。如果母猪是在产后跟胎，那仔猪母源抗体会偏差，首免时间就需要在20-25天。
3、对疫苗的免疫剂量认识不深
不同的疫苗品种、以及不同的生产企业、不同系列，免疫剂量也不同。比如，猪瘟疫苗，使用普通细胞苗，可能需要免疫4-5头份才行，高效细胞苗，可能需要免疫2-3头份，ST猪瘟活疫苗，效价高，只需要免疫1头份就可以。
而对于不同的猪群，免疫剂量也要有适当调整，种猪群由于体型大，免疫剂量需要稍微加大，一般是保育猪的1.5-2倍剂量。但是对于一些繁殖能力强或者有一定残余毒株的疫苗毒株，种猪群也不需要加量，比如高致病性蓝耳苗，小猪大猪均只需要1头份即可；猪瘟-猪丹毒-猪肺疫三联苗，大猪小猪均免疫1头份。
4、随意调整免疫程序或者更换疫苗
稳定情况下，免疫程序尽量不要随意调整，但是抗体监测最好能够形成制度化。稳定情况，一般都是免疫到位，猪群得到全方位的保护，使用的疫苗、免疫的剂量和时间是合适的，不要随意调整。即使想调整，那也要往好的方向调整，如换成质量更好的疫苗，增加免疫剂量等。
5、不稳定情况下，疫苗推迟免疫或者暂停
一旦猪群出现不稳定，免疫程序是需要进行适当调整的，一般需要待猪群稳定或者用药控制以后。但是，仅仅是适当调整，而不能因为猪群不健康而把一些重要疫苗无限期推迟或者不免疫。恰恰相反，对于还没有表现症状的猪群，甚至需要把重要的疫苗免疫时间提前，或者增加免疫次数。比如，仔猪发生疑似的伪狂犬疫情，可以考虑母猪先进行加强免疫，然后仔猪结合滴鼻免疫和注射免疫；猪场正常是35天左右首免猪瘟疫苗，但是断奶仔猪最近在30多日龄时开始表现不稳定，这样可以把猪瘟疫苗首免时间提前到25天左右进行。育肥猪出现皮炎肾病综合症，可以考虑把仔猪的圆环疫苗间隔3-4周免疫两次。
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