如前文提及，畜禽粪便等废弃物的无害化处理和还田利用也是有标准可循的，如《畜禽粪便无害化处理技术规范》（NY/T 1168-2006）、《畜禽粪便安全使用准则》（NY/T 1334-2007）、《沼肥施用技术规范》（NY/T 2065-2011）、《畜禽粪便还田技术规范》（GB/T 25246-2012）、《粪便无害化卫生要求》（GB 7959-2012）、《畜禽粪便贮存设施技术要求》（GB/T 27622-2011）等。如果粪便等废弃物的无害化处理和还田利用没有满足上述标准而导致污染，则要依照《条例》承担相应的法律责任。
此外，还有一些地方存在要求沼液等液态肥还田要达到《农田灌溉水质标准》（GB 5084-2005）的情况，这显然是混淆了施肥和灌溉的基本概念，适用标准不当。从另外一个角度上看，液态肥如果达到灌溉水质标准，那么其中的肥料成分就要被处理掉，那也就改变了液态肥的本来属性和用途。
误解三：“禁养区”就是“无畜禽区”
有些地区在划定“禁养区”并进行清理整治的时候出现了对“禁养区”概念误读的情况，主要表现为划定的“禁养区”实行“全面禁养”，即划定区域内一头猪或其他畜禽也不能养，现有养殖活动一律限期清理。这是对有关法律法规的相关规定和表述的一种典型误解，是中国式简称导致信息和概念传导讹误的一种具体表现。
这里简单解释一下“禁养区”说法的来源。“禁养区”是相关法律和法规中所指的禁止建设养殖场和养殖小区的区域（即禁止建设达到省级人民政府设定养殖规模以上养殖场所的区域）的简称，而不是一头猪、一只鸡或其他畜禽都不让养的区域。相关表述最早见于《畜禽养殖业污染防治管理办法》（环保总局令第9号）（2001年）第7条“禁止在下列区域内建设畜禽养殖场：……”；之后《畜牧法》（2005年）中引用了这一概念，第40条规定“禁止在下列区域内建设畜禽养殖场、养殖小区：……”；《条例》则引用了《畜牧法》的表述。
可以看出，在相关法律法规中并未出现“禁养区”这三个字，所指区域也更不是一头猪都不让养的“无畜禽区”。
总结
综上，贯彻落实《畜禽规模养殖污染防治条例》，加强畜禽养殖环境保护，必须深入领会包括《条例》在内的相关法律法规的精神主旨，准确把握相关具体表述和基本概念，防止望文生义以及错误和片面地理解有关法律规定，防止简单机械地照搬和套用工业污染治理的概念和套路，防止片面强调“污水处理”和“达标排放”、将还田利用视为排放污染予以限制，甚至打着环保旗号采取因噎废食的方式、通过挤压产业发展的消极途径来“解决”畜禽养殖污染问题，而给产业发展造成不必要的麻烦和困扰，以至影响畜禽养殖业的健康持续发展，以保障畜牧业在支撑整个农业可持续发展乃至在农业生态文明建设中发挥应有的作用，同时推动畜禽养殖业整体的转型升级，实现产业的健康持续发展。
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