3.3 以沼气为纽带的种养模式
利用沼气池或者沼气罐在厌氧环境中通过微生物发酵将粪便转化为沼气、沼液、沼渣等再生资源，利用其沼液、沼渣用于养殖鱼、蚯蚓，用蚯蚓作动物饲料，沼液、沼渣还用于种植果、草等。建立畜禽养殖与种植资源综合利用生态链。但在实践过程中，畜禽粪尿虽经发酵但因发酵温度不够，无法彻底杀灭粪便中的病原微生物或寄生虫卵，可能造成动物疫病的传播流行，并危害社会公共安全。
3.4 以微生物、蝇蛆和蚯蚓为核心的种养模式
在西方许多发达国家，早就运用人工养殖蝇蛆和蚯蚓处理养殖场的粪便和城市垃圾。在养殖业中通常是先将畜禽粪便用EM菌或是类似的多种微生物进行充分发酵，再把发酵好的粪便用来饲养蝇蛆和蚯蚓，再用蝇蛆和蚯蚓代替精饲料饲喂鸡、青蛙、牛蛙等经济动物，利用完的粪便经过一定处理后用来生产肥料。整个过程中蝇蛆和蚯蚓自身产生的消化酶和天然抗生素可以杀死粪便中残留的微生物和病原体，再加上上游微生物的发酵作用，病原体的数量几乎降低到零点。饲养蝇蛆和蚯蚓利用畜禽粪便、垫草等养殖业的固体废弃物进行饲养。这种养殖模式具有粪便转化效率高、低污染甚至是零污染的特点，适合大规模推广。目前在我国广东和广西的部分地区已经成功应用。同时蚯蚓也是一种药用价值极高的传统中药，可以用来治疗多种人类和动物的疾病，还可以产生额外的经济效益。
4 几种比较典型的养殖模式
4.1 初级模式
主要是以养殖鸡、猪等畜禽为核心，产生的粪便经过特殊微生物发酵后再用来养殖蝇蛆和蚯蚓，再把养殖好蝇蛆和蚯蚓用来饲喂畜禽。饲养蝇蛆和蚯蚓的废弃物用来种植粮食和蔬菜，这些蔬菜和粮食可以用来出售，也可以继续用来饲养畜禽。
4.2 中级模式
畜禽养殖所排放的粪便用来养殖蝇蛆，养殖蝇蛆后的粪便用来饲养蚯蚓，养殖蚯蚓后的粪便用来种植粮食蔬菜，生产出的粮食和蔬菜可以继续饲喂畜禽。蝇蛆和蚯蚓可以用来养鱼和饲喂畜禽。EM微生物可以作用于以上的每一个环节，可以用来发酵粪便来去除病原微生物和粪臭；可以净化畜禽舍和鱼塘的环境和水质；还可以用来发酵由粪便转化而来的肥料。
4.3 高级模式
在中级模式的基础上加入了大规模养殖场、果园生产、桑园生产、养蚕、沼气池发酵、特种水产养殖、农村生活垃圾以及人粪处理、绿色蔬菜生产等环节。更能高效地处理人畜粪便，并将发酵后的粪便多次利用，能生产出种类更多的副产品。
5 发展生态循环养殖的几点建议
(1)发展生态循环养殖业有着良好的经济效益和环境效益，能从根本上解决发展规模养殖业所产生的种种矛盾，体现了未来养殖业的发展方向。地方主管部门应该认真调研，详细规划，并把发展生态养殖业作为一项系统工作制定近期和中长期的发展规划，调动各个相关部门的力量真抓实干。
(2)对现有的规模化养殖场以项目的形式加以引导，促进其逐渐朝着生态循环养殖业转变。或者通过引入重点企业，发展生态循环养殖工业区，在生态循环养殖的基础上配套食品、中药材等其他产品的生产加工，使传统农业由以前的粗放型逐渐向工业型转变。
(3)因地制宜，探索适合当地的良性生态循环的养殖模式，以获取最大的生态效益、经济效益和社会效益。建立适合生态养殖业发展的创新机制。完善有关的法规制度和有效发展机制。要提高集约化养殖环境控制能力，加强设施建设。建立生态型养殖小区，实现粪污零排放。
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