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2.4 核苷酸序列分析 对此次感染鸭群的Ⅰ群禽腺病毒hexon序列PCR扩增后进行测序，并与 5 株Ⅰ群禽腺病毒 C 亚群病毒株进行核酸比对分析。根据同源性分析， 发现本研究分离得到的 3 株血清 4 型毒株与 C 亚群毒株 同源性最高， 达97.9%~99.9%，其中，与 RC 病毒株同源性高达 99.0% 以上，与 2015 年分离到的 HN/151025 病毒株同源性最高，达到 99.9%。而从山东德州分离到的血清 1型毒株与 A 亚群病毒毒株具有较高同源性；SDDZ株与 CELO、G026 及 W15 等 A 亚群毒株同源性达95.9%~99.0%，其中与 2012 年的 G026 分离株同源性最高，可达 99.0%（图 3）。通过分离株与 C 亚群标准毒株的比对分析，发现在 Hexon 基因区域，共计 19 个核苷酸位点出现突变。 
图 3 各分离株亲缘性分析 3 讨论 目前为止，Ⅰ群禽腺病毒的基因组信息还十分有限。在整个基因组水平需对禽腺病毒进行广泛地遗传进化分析，从而了解禽腺病毒分离株的进化情况。目前，有研究从我国大陆地区分离到的 3 株禽腺病毒流行株，并测定了全基因组序列，发现基因组全序分别为 44 081、43 966 及 43 756 bp，与其他禽腺病毒具有类似的基因结构，其中 HBQ12及 BJH13 属于 FAdV-D 并且发生 TR-1 和 TR-2 序列突变。对于 JSJ13 毒株，在基因组中没有发生TR-1 或 TR-2 序列的缺失，这与 KR-5 株（GenBank登录号：HE608152）和 ON1 株（GenBank 登录号：GU188428）保持一致。然而，这些变化对病毒基因组的生物学影响尚不清楚。 在本研究中，共分离到Ⅰ群禽腺病毒 4 株，其中，血清 1 型 1 株，血清 4 型 3 株。通过遗传发育分析得知，此次分离到的Ⅰ群禽腺病毒毒株与近年我国大陆地区其他分离株具有极高同源性。同时，检测数据显示，鸭胚样品中，Ⅰ群禽腺病毒的感染阳性率均高于 20%，甚至有两个批次样品高达 50%；而雏鸭样品阳性率均高于 30%。 由此推断，自 2015 年报道Ⅰ群禽腺病毒血清 4 型在我国肉鸭群中大规模爆发以来，Ⅰ群禽腺病毒的感染仍大范围存在，而且遗传进化分析显示，临床感染优势毒株仍为心包积液肝炎综合症的主要病原——血清 4 型毒株。
目前，Ⅰ群禽腺病毒的 12 个血清型均被报道可引起包涵体肝炎，然而不同血清型毒株的致病性各不相同，而至今为止最严重的是血清 4 型毒株所造成的心包积液综合症 。
Ⅰ群禽腺病毒共包括 3 个亚群，12 个血清型，目前普遍存在于鸡、鸭、鹅体内，其呈隐性感染状态，并且可垂直传播，造成商品禽感染发病。有研究证实，不同动物群体中的感染情况并不相同，其中鸡群阳性率为 51.4%，鸭群为 51.7%，鹅群为17.3%。在本次研究中，120 份表观正常的种鸭样品中检出阳性 34 份，阳性率为 28.3%，说明该种鸭群处于隐形感染状态，鸭胚检测 PCR 阳性率为20%以上，提示可能在后期养殖过程中会暴发疫病。
血清 4 型腺病毒既可在个体之间或养殖场之间通过排泄物 - 口腔途径发生水平传播，也可通过种蛋进行垂直传播。本次研究结果表明，在疫区内，表观正常种鸭群也可能处于隐性感染状态，鸭胚检测呈 PCR 阳性。因此，在养禽大环境不容乐观的当下，种禽带毒传播的风险不容忽视。
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