我国西南地区H5N6亚型禽流感病毒基因型的多样性以及传播路径分析

自2014年首次报道人感染H5N6亚型流感病毒以来，H5N6不断在我国以及东南亚国家的家禽中爆发流行，并持续出现感染人的病例。H5N6亚型禽流感病毒宿主分布较为广泛，除了感染家禽之外，还感染野鸟，猪，猫，狗等宿主。此外，H5N6亚型禽流感病毒在全世界逐渐呈现扩散的趋势，目前已经在中国、越南、老挝、韩国、日本、英国等地区相继出现H5N6亚型禽流感病毒，并且其内部基因持续与低致病性禽流感病毒发生动态重配现象。

之前大量研究表明我国南方地区是H5N6亚型禽流感病毒的主要“聚集地”，也是南方地区禽流感病毒主要流行的亚型。但是，关于我国西南地区H5N6亚型禽流感病毒的研究却很少，我国西南地区位于中亚和东亚-澳大利亚候鸟迁徙线，并且靠近南亚一些国家，并且2014-2016年相继在我国的四川、云南、广西等地区出现H5N6流感病毒感染人的病例，因此，对我国西南地区的H5N6亚型禽流感病毒的进化分析刻不容缓。

华南农业大学兽医学院亓文宝教授课题组自2015年初至2017中旬在我国云南和广西等地区的活禽交易市场、养殖场对鸡、鸭、鸵鸟、鹌鹑等动物进行持续的流行病学调查，分离到128份阳性样品。通过病毒分离鉴定、全基因测序，结果表明我国西南地区主要的禽流感病毒亚型为H5N6，H7N9和H9N2，其中H5N6为主要流行的亚型。进一步对H5N6进行遗传进化分析，发现除了一株H5N6处于2.3.2分支以外，其余都为2.3.4.4分支，有趣的是，H5N6病毒在感染人之前，环境中病毒的动力学较为复杂，内部基因出现了多种重配现象，其中包括PB2与H6亚型禽流感病毒发生重配，PB1与蒙古流行的H10亚型禽流感病毒发生重配以及与H3亚型猪流感病毒发生重配。此外，通过对我过西南地区H5N6亚型流感病毒基因型分析，发现西南地区基因型呈现多样性，其中包括G1, G2, G1.1, G1.2, G1.1.a, G1.a, G1.1.b等，其中在广西地区鸵鸟身上分离到的G1.1.b基因型与广西2016年底H5N6感染人的基因型相同，并且基因的同源性很高， H5N6亚型禽流感病毒能够在当地进一步发生重配进而跨宿主传播感染人。

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