如果猪感染之后形成完全免疫力（将PRRS病毒从猪体内一切组织当中清除掉）需要150天之久，那么这就容易解释为什么青年母猪妊娠的仔猪容易发生子宫内PRRS病毒感染了。地方性PRRS很可能就是因为不断地有青年母猪通过子宫内感染将病毒传给所产仔猪，这些仔猪可携带病毒达数月之久，从而在这几个月期间，包括断奶期和生长、肥育期，不断将病毒传给同群的其它猪。这种假设能够解释为什么通过"分胎次隔离生产"能够根除二胎以上母猪所产仔猪群当中的地方性PRRS，而将地方性PRRS限制在头胎母猪所产的猪群当中。 PRRS病毒免疫反应：能保护，还是不能保护， 这真是个难题
介绍：猪对不同毒株PRRS病毒感染的"交叉"保护性免疫反应非常有限，甚至根本没有。对PRRS病毒的免疫反应范围似乎非常"狭窄"，这种情形很像导致艾滋病的人免疫缺陷病毒（HIV）及其近亲猫科动物免疫缺陷病毒。这种交叉保护的缺陷可能是因为病毒的突变（基因序列的改变）速度太快，造成这种病毒的毒株（不存在交叉免疫保护的毒株）比流感病毒的毒株还要多得多。这样，对PRRS病毒几乎没办法进行免疫学分类，也没办法预测哪两种毒株之间存在交叉保护，这是因为：1）我们对PRRS病毒免疫保护所需的机制了解甚微，2）我们还不知道免疫反应作用的目标位点，因此 3）我们无法判断PRRS病毒基因序列的哪些变化是重要的，哪些是不重要的！讨论PRRS病毒免疫问题的时候，有的人使用科学术语，有的人使用一般描述性术语，还有的人把前两种掺和到一起使用（行话）！ 这种用词习惯在兽医和兽医"科学家"当中很普遍，当我们讨论PRRS病毒的控制问题时，这种习惯常常会造成困惑，有时还会带来严重困扰。
PRRS病毒免疫反应的定义：
同源PRRS病毒 指的是经试验室检测具有相同基因序列的两个病毒分离样本。
异源PRRS病毒 指的是经试验室检测具有不同基因序列的两个病毒分离样本。这两种病毒之间可能只差两个变异（同源性 > 99.5％），也可能相差很多很多个变异（同源性 < 85％）。不同病毒之间的异源性是个重要的指标，它决定了二者引起的疾病之间存在多大程度的交叉保护。然而，根据"基因同源性百分数"无论如何也不能预测两种PRRS病毒之间的交叉保护程度！这是因为，同源性百分数无法说明变异发生的位置，从而无法确定这些变异是否发生在免疫反应的目标作用位点上。
受保护猪只：在面临PRRS活野毒挑战，或人工注射PRRS活野毒时，对疾病具有完全抵抗力的猪只。获得免疫保护的猪只，只有面对与上次完全相同的，或称同源病毒的挑战时，才具有完全的、可预期的免疫保护。
易感（未受保护）猪只：
1. 发生PRRS野毒感染之后，以前从未接触过或感染过病毒的猪只显然属于易感猪只。
2. 原先对某种PRRS野毒已经具有免疫保护力的猪只在面对一种基因序列不同的，或者说"异源性"的PRRS野毒时，易感性可能仍然很高！！！
3. 同样道理，经过免疫接种的猪只对PRRS野毒的易感性也可能会很高！根据定义，转型活毒疫苗的基因序列本来就不同于任何一种野毒。
4 . 易感性是对PRRS病毒具有免疫保护的反义。猪只对异源性PRRS病毒的免疫反应程度变化范围非常大，从具有完全保护（我们可能不知道该猪只以前曾接触过病毒），到完全没有保护/完全易感，发生严重临床疾病。到目前为止，还无法通过比较两种PRRS病毒的基因序列来判断二者之间的交叉免疫程度。我们不知道任何细胞介导免疫反应作用于PRRS病毒的目标位点在哪里。不过我们至少知道血清中和抗体的一个目标位点。这可以帮我们判断血清中和抗体对异源性PRRS病毒的交叉中和能力，从而对判断交叉保护程度也有一定的帮助。
PRRS病毒毒株 是具备下列特性的不同的病毒分离： 1) 基因方面不相同，或称具有异源性，并且 2) 其中一种PRRS病毒对另一种不存在"良好"的交叉保护。.用其中一种让猪只产生免疫保护，之后用另一种攻毒，猪只仍然会感染并出现临床疾病。最极端的异源毒株包括一种急性PRRS病毒，这种病毒1996－1998年间在美国的经常进行免疫接种的猪群当中爆发，引发了严重疾病，2001－2004年间又在对PRRS野毒已经具有免疫力的猪群当中爆发。至于临床症状应该会有多严重，通过什么样的临床症状或中和抗体/免疫反应测试结果来判断两种病毒之间是否 "缺乏交叉保护"，目前还不能确定。遗憾得很，这样的结论都是事后才能得到的，也就是说，已经将不同来源的生长猪、母猪以及更新后备母猪进行混群，或使用了感染异源PRRS病毒的精液，引起了PRRS的严重爆发，经济损失已经造成。
亚群 是母猪或后备母猪群当中容易感染（从未接触过病毒）或再感染（丧失了保护性免疫能力）PRRS的子群。它们对PRRS的免疫力较低或根本没有。即使是已遭PRRS病毒感染的猪群，在面对一种不同的PRRS毒株时，同样有可能全群都易感。谈到猪群当中从未接触过病原的小群体，比如新购入的更新后备母猪，"亚群"是一种行话术语，具有明确的含义。可是当谈到那些"丧失了原有免疫保护能力"，也就说对先前感染过的同源PRRS病毒丧失免疫力的小群体时，这个词的含义就不那么清晰。当猪群因接触第二种异源病毒而爆发PRRS疾病成为"阳性"之后，猪群中仍然可能存在亚群。 PRRS病毒免疫：同源免疫是针对先前感染过的同一种PRRS病毒的免疫。通常认为这种病的免疫效果是长期的，然而，并不是说这种免疫力就可以持续一生。同源免疫是猪体能够产生的最有效的免疫反应，换句话说，对同一种病毒的的免疫保护基本上是完全彻底的。
异源免疫指的是受保护猪只对另一种病毒所具有的免疫保护能力。猪体对于异源性病毒所能产生的交叉保护常常达不到同源免疫反应的程度。有些情况下甚至观察不到异源免疫反应。某种病毒所激发的针对另一种病毒的异源免疫的程度大小很可能取决于这两种病毒基因序列的相似程度，也就是说，两种病毒蛋白之间在多少个免疫反应位点上存在差异。现在让兽医专家和科研人员倍感头疼的一个问题是，我们不知道要想激发完全的交叉免疫保护哪些基因序列必须相同。 PRRS病毒免疫反应原则： 病毒同源基因序列与病毒防控的关系：典型情况下，各兽医诊断试验室仅对PRRS病毒的5号阅读框（ORF 5）进行定序、比较。这个阅读框对主要的糖蛋白进行编码，该糖蛋白从病毒的外包装，或称病毒壳，向外伸出。兽医诊断试验室报告中给出的ORF 5序列在完整的PRRS病毒基因组中的比例仅为4.4％（15,000个碱基对当中的660个）。兽医专家利用这个ORF 5序列对不同的PRRS病毒样本进行比较。目前已知的只有一个中和抗体作用位点是由ORF 5编码的。然而，由ORF 5以及其它七个ORF编码的未知而重要的抗体作用位点以及细胞介导免疫作用位点可能还很多。
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