从2010年春节前后，一直到现在，猪群病毒性腹泻给养殖业带来了很大的打击和巨大的经济损失。当前腹泻性疫病爆发流行，病因复杂，危害增大。除了引起猪群腹泻的传统的三大病原流行性腹泻、传染性胃肠炎和轮状病毒外，最新报道的库布病毒（kobuvirus）、博卡病毒(bocavirus)、诺如病毒(norovirus)在猪群腹泻发病过程中也起了很重要的作用，这三种病毒在猪场的检出率非常高。，目前所流行的腹泻，从发病猪场、病料、粪便当中检出的最高是流行性腹泻病毒、库布病毒（kobuvirus）和博卡病毒(bocavirus)三种，这三种病毒的感染率是最高的。但是究竟是三种病毒的其中一种在猪群腹泻的发病过程中起了重要作用还是三种病毒混合感染协同起作用，这个问题还有待于更进一步深入的研究，现在对于病毒的分离鉴定工作很多单位都在做。而除了引起猪群腹泻的病毒性因素之外，免疫抑制、细菌性腹泻、饲料霉菌毒素、生物安全、环境因素等等这些都是诱导和促进腹泻发生的重要原因。
对当前养猪业造成巨大经济损失的三大疾病：腹泻（多病原混合感染或者多病原引起）、呼吸道问题、繁殖障碍（引起母猪返情，配不上种，产死胎、产木乃伊胎、产弱仔）等，这三大类型疾病是当前影响我们养猪业的最主要的原因。
第一、免疫抑制病威胁逐渐加剧
蓝耳、圆环病毒、附红细胞体等免疫抑制性疾病，破坏淋巴细胞和免疫系统，从而降低机体的免疫力，机体容易发生继发感染；而猪群饲喂的饲料霉变，霉菌毒素、烟曲霉毒素等毒素导致机体发生免疫抑制，使猪群长期处于一个亚健康威胁的状态。同时还影响猪瘟、伪狂犬等疫苗的抗体水平或对其他疾病的抵抗力下降，进而激发猪群感染呼吸系统疾病。
第二、多种病原的混合感染越来越普遍
细菌之间的混合感染主要有三种：副猪嗜血杆菌和链球菌混合感染，肠外致病性大肠杆菌、副猪嗜血杆菌和链球菌的混合感染，胸膜肺炎放线杆菌和巴氏杆菌的混合感染，细菌之间的混合感染主要危害的是肥猪和种猪。此外，陈院士还提到，有一个不容忽视的问题是，最近一两年，肥猪或种猪因胸膜肺炎放线杆菌和巴氏杆菌导致发病死亡的现象越来越多。他表示，1999年到2004年间，由他第一次分离出胸膜肺炎，当时主要是以胸膜肺炎为主，后来2004年至2005年又分离出副猪嗜血杆菌后，副猪嗜血杆菌非常严重，相反胸膜肺炎有所下降。这两年胸膜肺炎又有大量抬头的的趋势，而且国外引进的种猪十有八九是有胸膜肺炎。副猪嗜血杆菌和链球菌的混合感染在保育舍和生长前期是一个大问题。
病毒之间的混合感染主要是蓝耳病毒、圆环病毒和猪瘟之间的混合感染，猪瘟和伪狂犬也会混合感染等等。再者就是细菌病毒寄生虫的混合感染。而提到高热病，陈焕春院士表示，高热病不能当成是一个兵，高热病是蓝耳病病毒、圆环病毒、加上附红细胞体，又继发了副猪嗜血杆菌、链球菌、大肠杆菌、胸膜肺炎这些高死亡率的细菌性疾病等等而导致的。他曾经接触过一些发生高热病的猪场，猪群的成活率不足20%，而通过分析病原然后进行一一控制，现在猪场的成活率达到了95%。他还介绍，在中小型的养猪场细菌病毒寄生虫再加上一个附红细胞体的混合感染是主要的因素，而规模化养殖场，圆环病毒、蓝耳病和细菌混合感染的现象比较严重。
第三、细菌性疾病不容忽视，在猪群发病致死中扮演者重要的角色
对于猪场细菌性疾病对不同阶段的猪的影响和发病情况，陈焕春表示在猪场的产仔舍，仔猪出现严重的关节炎，大量的耳尖发绀、尾尖发紫，腹部、下肢发紫等症状，则肯定是副猪嗜血杆菌，因为链球菌没有这么严重；而从产仔房到了保育舍再到分散舍，主要问题是副猪嗜血、链球菌或者是大肠杆菌比较严重，其中副猪嗜血杆菌危害4月龄以内的猪，4月龄以上发病猪不是副猪嗜血杆菌病；4月龄以上或者生长为生长肥育的后期或者种猪，大量地发生呼吸道的问题或者急性死亡或者慢性的疾病则主要是胸膜肺炎。
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