自2006年我国高致病蓝耳病的爆发流行后，约80%的猪场每年都有该病的流行，临床表现以母猪的繁殖障碍和仔猪的呼吸道症状为特征，部分猪场平时以隐形带毒为主，随着季节和饲养条件的变化再表现疾病状态。混合感染常常使发病猪群的死亡率大幅提高，经常给猪场带来毁灭性的打击。此外，在猪瘟和伪狂犬免疫不力的猪场，蓝耳病发生率高，感染后的发病率和死亡率也明显高于基础免疫较好的猪场。
鉴于蓝耳病毒的传播速度快，加上我国多数猪场均无不同程度的流行，目前主要的防疫措施对猪场实施疫苗免疫接种。据美国农业部公布的报告确认，该国有53%的猪群接种疫苗，其中大型猪场接种者达70%，使用弱毒疫苗的占65.5%。在过去数年内，我国许多猪场使用进口或国产的猪繁殖和呼吸综合征活疫苗，但是防疫效果并不理想。表现在接种后疫病不能有效控制，或者尽管接种了疫苗，但不能阻止流行蓝耳病在流行季节的爆发。
免疫失败的原因可能存在于三个方面，第一，疫苗毒与野毒的抗原性间存在差异。目前我国养殖业界和疫苗生产企业对这方面的认识存在较大争议，部分企业界人士认为我国许多地方流行的蓝耳病毒仍是经典美洲型病毒，但这一认识可能与现实有较大差距。天津市疫控中心等多家研究机构对我国近几年来蓝耳病流行毒株的基因相似性进行对比，结果发现，我国的流行毒株不但与进口疫苗2332株有明显差异，与我国早先的经典疫苗毒株的亲缘性也较远。这足以说明，我国目前的流行毒株是高致病性蓝耳病的弱化毒株，其抗原性可能更接种于高致病性蓝耳病，而不是经典蓝耳病毒株。这一点需要特别注意。中国科学院动物研究所的研究人员也把我国蓝耳病的基因相似性与经典美洲株及欧洲株进行比较，结果我国蓝耳病毒不但在基因相似性方面有不同，其抗原性也有明显差异。
最新研究发现，如果把蓝耳病非结构蛋白的部分基因缺失的话，病毒对猪的毒力明显下降，但其刺激猪细胞免疫的能力大幅提升，这提示，过去的许多蓝耳病弱毒苗可能有一定的免疫抑制活性，这一点应引起注意。
第二方面，许多猪场并未根据自身的疫病流行特点制定免疫方案，加上此前的疫苗可散毒，总有部分猪处于易感状态，疫苗毒或野毒的循环感染造成猪场蓝耳病难以净化，形成长期的防疫隐患。因而，如何更好地理解蓝耳病的流行、感染、免疫特点成为制定免疫方案的关键。
第三方面，鉴于生产成本的压力，部分养猪场难以做到全封闭饲养，隔绝外部疫病传入就比较困难。实践发现，如果能有效地落实基础免疫、消毒隔离等措施，中小型猪场同样能远离蓝耳病。
总之，深入进行新形势下蓝耳病的临床研究，针对各猪场的具体情况，合理使用疫苗、消毒及隔离等防案，完全有可能控制蓝耳病。
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