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一、禽流感病毒（H7N9）及其来源
2013年3月31日，中国卫生和计生委报告上海和安徽两地发生3 例人感染H7N9 禽流感病毒的确诊病例，其中2例死亡，1例重症。序列进化分析表明该病毒与既往流行或感染人的H7亚型流感病毒以及野鸟中流行的H7N9禽流感病毒完全不同，是一种新型重配的禽源性流感病毒。Lam等人通过对大量相关的病毒序列的进一步分析，比较完整地阐明了新型禽流感病毒H7N9的起源。2013年暴发流行的H7N9病毒属于至少三个不同的禽流感病毒重配的结果，其中H7来自于水禽中的H7N3病毒，N9来自于水禽或野鸟的H2N9或H11N9。H7基因与N9基因的重配大概发生在2011年中至2012年中，在水禽中重配形成的H7N9病毒前体。2011年中至2012年末，H7N9病毒前体与鸡中普遍流行的H9N2病毒发生进一步的重组使得H7N9病毒具备了H9N2的5个内部基因，最后形成了新型的H7N9禽流感病毒。2013年3月，H7N9病毒在上海、安徽暴发流行后，疫情迅速蔓延，1个多月后波及北京、江苏、浙江、山东等多个省份和地区。2013年-2017年，H7N9禽流感病毒在中国已引起连续5波人感染禽流感病毒疫情。通过对H7和N9两个基因的时空进化分析，H7N9病毒在进化过程中逐渐形成了长三角株和珠三角株两个大的进化分支，并具有一定的地域分布特点。其中，长三角分支的H7N9病毒主要在中国东部、东南部、中部以及广东省粤东地区流行，是引起这些地区人感染H7N9禽流感病例的主要病毒分支。而珠三角分支的H7N9病毒相对比较局限，主要在珠三角地区流行，少量珠三角分支的H7N9病毒也传播到邻近地区（如粤东地区及福建省等）。
二、H7N9感染与活禽市场的关系
1、不同类型场所中H7N9的监测结果
不同地区监测场所中H7N9总阳性率不一致，但总体而言，活禽交易市场阳性率要高于规模养殖场和散养户。如2014年1月至2015年4月在厦门市69个监测点的检测结果也发现，H7N9阳性标本检出率高达为56.52%，其中以城乡活禽市场阳性率最高（79.59%），其次为散养户(11.76%)，养殖场未检出阳性标本。在广州市番禺区外环境监测中发现肉菜市场中H7N9阳性率要大于禽类批发市场和禽类养殖场，其阳性率分别为7.22%、2.04%和0.00%。禽类规模养殖场、家禽养殖散养户、野生候鸟栖息地等场所H7N9亚型禽流感病毒阳性率都很低，如广州市2013至2015年监测期间在上述场所中都未检出H7N9病毒。提示市场禽类摊点和禽类批发市场是人感染H7N9亚型的高风险场所。但是2013年7月至2014年2月期间在浙江的监测发现，活禽养殖场H7N9的阳性率远大于农贸交易市场、活禽宰杀场，其阳性率分别为20.00%(3/15)、10.53%(4/38)和0.00%，提示有些地区的养殖场也是H7N9感染和传播的高风险场所。
2、不同类型标本的H7N9监测结果
对鸡等陆禽以及鸭、鹅等水禽的监测发现，鸡携带H7N9的比例要远大于鸭鹅等。浙江省永嘉县检测的鸡标本阳性率为2.02%(23/1138)，其中活禽养殖场和农贸交易市场的鸡标本阳性率较高，分别为2.25%(14/623)和2.54%(9/355)，但鸭标本均为阴性。在广州市的监测也发现鸡等陆禽的H7N9阳性率（3.34%）高于鸭、鹅等水禽（1.67%）。
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