图4. 台湾分离毒株(NPUST2789)和其他蓝耳毒株的完整基因组、ORF1a、ORF1b、ORF2、ORF3、ORF4、ORF5、ORF6和ORF7基因序列构建的进化树。 灰色底层代表本研究中分离的台湾欧洲型蓝耳毒株。
图S1 台湾分离毒株全基因组核苷酸序列与其他蓝耳毒株全基因组的同源性 3.3 ORF5核苷酸、氨基酸序列遗传学分析 另一头3周龄发病仔猪和另一头发病母猪的ORF5测序分析与NPUST2789毒株ORF5序列几乎相同。相比之下台湾分离到的欧洲型蓝耳毒株NPUST2789与其他欧洲型蓝耳毒株(Leylstad和HUN60077/16)进行核苷酸和氨基酸序列同源性分析发现,台湾爆发的欧洲型蓝耳毒株与欧洲蓝耳疫苗毒株 Amervac PRRS同源性相当高(表2和图S2)。综上所述,这些结果证实了台湾欧洲型蓝耳病的爆发与欧洲疫苗毒株 Amervac PRRS有着共同的起源。 表2 台湾分离毒株与参考比对株之间核苷酸和氨基酸序列同源性分析
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