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自然养猪法中的技术核心之一就是“发酵床”（就是填入垫料池中垫料原料的总称），可以说，发酵床制作的成功与否，决定了日后的经济效益。其主要原料为锯末、稻壳、麸皮、环保生物素等。
1、原料的功能及质量要求
锯末：保水，为环保生物素发酵提供水份和碳素，应当是新鲜、无霉变、无腐烂、无异味的原木生产的粉状木屑，且不得含有防腐剂、驱虫剂等。
稻壳：疏松透气，为环保生物素发酵提供氧气，应当是新鲜、无霉变、无腐烂、无异味、不含有毒有害物质，不必粉碎，应当是片状的。可用花生壳代替。
麸皮：为环保生物素提供营养。可用玉米粉、米糠代替。
环保生物素：高效的发酵菌母种。
垫料制作的过程其实是物料发酵的过程，其目的一方面在垫料里增殖相当数量的有益的优势菌群，为猪只入舍做好准备；另一方面通过发酵过程产生的热量杀死有害菌。
2、材料用量的计算
不同的材料、不同季节所占的比例是不一样的。表4-1简要列出了针对育肥猪生产的垫料用量大致比例，其他类型的猪也可以参照使用。 | 原 料 | 稻壳 | 锯末 | 麸皮 | 环保生物素 | | 用量 | 0.6-0.4m3 | 0.4-0.6m3 | 2kg | 200克 |
因干的稻壳和锯末都较疏松，故在计算实际垫料的用量时，应多预算20%的体积数量进行发酵，补充垫料经发酵和猪只踩踏后的下沉萎缩部分。
3、垫料发酵的操作步骤
垫料发酵的目的是创造一个有益微生物生长繁殖的良好条件，如水分、营养等，使其迅速大量增殖，释放出热能，使发酵床温度达到60-70℃左右，从而有效杀灭病原微生物，如病毒、细菌、霉菌、寄生虫及蝇蛆等。
（1）环保生物素的扩繁
将环保生物素均匀混合到麸皮中。 
（2）干原料的摊开铺平
第一层铺稻壳，将稻壳平铺于地上；第二层将“环保生物素麸皮混合物”取出一半均匀撒满在稻壳上；第三层是将锯末铺在上面；第四层将剩余“环保生物素麸皮混合物”均匀撒满在锯末上。 
（3）干垫料混合
将铺开的垫料混合均匀。如果有结块的稻壳或锯末应拍散。 
（4）加水混合
将混合均匀的干垫料进行加水混合，水分一般在45%-50%左右比较合适，现场实践是用手抓垫料来判断，即物料用手反复捏紧几次，手能明显感觉垫料有湿度，无干粉，且手心无明显水珠，手指缝无水滴滴下为适宜。
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