2. 流行性腹泻病毒(PEDV) 2023年4月份,检测中心完成4株PEDV Spike蛋白基因(S)测序,根据S1基因进行基因分型,检测出1株G2b基因型毒株(25.0%),3株S-INDEL-LIKE基因型毒株(75.0%)(图3)。 在G2b分支中,测序株与市售疫苗株的核苷酸一致性在97.4%~97.7%;在S-INDEL-LIKE分支中,测序株与市售疫苗株的核苷酸一致性在92.6%~94.0%。
图3. 2023年4月份PEDV S1基因进化树 3.轮状病毒 (PoRV) 2023年4月份,完成5株PoRV VP7(G基因型)基因测序,2株(40.0%)为G5基因型,2株(40.0%)为G9基因型,1株(20.0%)为G3基因型(图4)。 在G5分支中,测序株与疫苗株的核苷酸一致性为72.6%~77.4%;在G9分支中,测序株均与疫苗株的核苷酸一致性为83.0%~86.6%;在G3分支中,测序株与疫苗株的核苷酸一致性为67.4%~68.8%。
图4. 2023年4月份PoRV VP7基因进化树 4. 猪圆环病毒 2023年4月份,根据PCV2 Cap蛋白编码基因进行分型,完成3株PCV2测序,分别属于PCV2a、PCV2b和PCV2d分支。在PCV2a分支中,测序毒株与LG信得疫苗株的核苷酸一致性为95.8%;在PCV2b分支中,测序毒株与DBN-SX07-2信得疫苗株的核苷酸一致性为99.5%;在PCV2d分支中,测序毒株与信得疫苗株的核苷酸一致性为95.3%~97.0%。 2023年4月份,根据PCV3 Cap蛋白编码基因进行分型,完成2株PCV3测序,均属于PCV3a分支;与参考株核苷酸一致性为96.7%~99.2%。 |