在影响生猪效益的诸多因素中,优良的种猪起主导作用。选种是种猪遗传改良的关键环节,提高选种的准确性是育种工作者的主要任务。当前,全基因组选择技术研究已成为猪育种工作的重要内容。 相比传统的育种技术,全基因组选择的主要特点是利用全基因组遗传标记信息,实现对个体的选择,以加快遗传进展,提高育种效率。 种猪改良最关键部分在于选种,目前主要通过个体本身和有亲缘关系个体的表型值,以BLUP法估计个体育种值,再根据育种值进行选种。个体育种值实际是由基因控制的,如何选择控制表型值的基因,在基因水平上直接选种,是育种工作的难点。 回顾选种技术的发展,早在我国春秋时期就有伯乐相马、宁戚相牛的典故,他是通过血统来源结合对部分性状经验的判断来选种的,这是一种通过表型值结合系谱的选择方法;随着数量遗传学的发展,到70年代科学家建立了BLUP的遗传分析方法,这是一种计算技术,将大量的表型值估算成个体育种值,这种方法更科学、更准确;随着分子生物学的发展,发现了一些性状的主效基因或关联主效基因的位点,建立了标记辅助选择结合BLUP估计育种值方法;近十年来,全基因组选择技术得到了蓬勃的发展,可以显著提高育种效率。 全基因组选择的基本原理是个体间存在大量的SNP(单核苷酸多态性,也即基因组序列的差异位点),这些SNP与性状间有连锁和不完全连锁的关系,每一个SNP可以建立一个基因育种值。个体性状基因组育种值就是大量SNP效应的累加值。因此,可以由基因型估计育种值,根据育种值高低进行选种。 一、全基因组选留的基本步骤 全基因组选择的基本步骤分为两部分。第一步是建立参考群,参考群的每个个体需有表型数据和SNP基因型,通过统计模型计算SNP效应得到个体基因组育种值;第二步是测定候选群体SNP的基因型,利用第一步得到的SNP效应,计算个体的基因组育种值,再根据基因组育种值选留个体。 全基因组选择技术的三个关键点:第一是参考群体,第二是SNP分型技术,第三是统计模型算法。 二、全基因组选择育种相关关键技术 |
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