与不同冠状病毒遗传进化分析 (三)从不同冠状病毒基因结构来说 根据不同冠状病毒基因组结构,利用不同颜色方框和排列方式代表病毒基因组基因排列和结构,家畜冠状病毒、家禽冠状病毒在病毒编码结构蛋白的大小、数量以及顺序均与2019年新型冠状病毒不同。 从冠状病毒基因结构来说,新型冠状病毒(2019-nCoV)与家畜、家禽冠状病毒不一样。
三、新型冠状病毒(2019-nCoV)与家禽、家畜冠状病毒宿主能交叉感染吗? (一)从不同冠状病毒感染机制来说 病毒需要寄生在活细胞中才能繁殖,所以病毒侵入机体第一步就需要吸附到宿主细胞特异性受体上。新型冠状病毒的关键蛋白有两个功能单位S1和S2。S1起关键作用,含有一个重要的C端RBD(受体结合结构域)是负责决定与宿主细胞上受体结合与否。 目前研究发现2019-nCoV结合的受体是ACE2(血管紧张素转化酶2)。禽类与哺乳动物在进化程度上存在很大不同,其机体细胞不具备武汉新型冠状病毒结合的受体,猪的ACE2与人的ACE2结构特征差距甚远,目前的研究数据不支持新型冠状病毒感染畜禽,也没有畜禽往外传播该病的报道。 从不同冠状病毒感染机制来说,新型冠状病毒(2019-nCoV)与家畜、家禽冠状病毒宿主不能交互感染。
图4:新型冠状病毒的预测结构和RBD结构域的关键氨基酸(来源:武汉病毒所石正丽团队) (二)从不同冠状病毒S基因来说 新型冠状病毒(2019-nCoV)与禽、猪的冠状病毒S蛋白基因核苷酸同源性分别为38.5%-42.5%、37.8%-42.7%(如图-5);氨基酸同源性分别为22.8%-23.8%、22.9%-27.8%(如图-6);故不同物种间冠状病毒S基因同源性很低。计算成对核苷酸遗传距离(如图-7),新型冠状病毒(2019-nCoV)与其蝙蝠亲戚遗传距离只有0.226,与禽冠状病毒、猪冠状病毒平均成对核苷酸遗传距离分别为1.317、1.272。 从不同冠状病毒S基因来说,新型冠状病毒(2019-nCoV)与家畜、家禽冠状病毒宿主不能交互感染。 |