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10月份开始气候逐渐转冷，昼夜温差变化较大，经常出现15度左右的剧烈升降温，夜间温度低于15度，常伴有大风天气，空气湿度较低30%左右，总体表现为呼吸道疫情增加。腺病毒随种源情况波动较大，部分区域流行严重，种禽防疫或腺病毒(含有三种血清型的腺病毒疫苗效果最好)的商品代基本不发病。
由于气候的频繁变化使鸡舍环境控制较为困难，各个地区(山东，河北，东北等地)呼吸道疾病发病率明显上升，小日龄鸡在7天内就开始咳嗽、甩鼻等症状，做完7日龄首次免疫后，呼吸道症状有所加重，药物控制和饲养管理不当在17、8天容易继发感染大肠杆菌和气囊炎腹膜炎，并且一旦混感较为顽固不易治愈，部分区域出现支气管栓塞症状，发病很快，伤亡率增长迅速。
防控建议：10～12月份呼吸道疾病高发期加强净化支原体，鸡苗较差的在开口药开始净化支原体，提高机体抵抗力，可以有效控制前期呼吸道症状的发生，另外严格控制大肠杆菌继发感染，可以有效降低伤亡率，同时根据当地流行疫情合理安排疫苗防疫程序，大病靠防疫，小病靠治疗。
通过实验室药敏检测结果显示：本阶段突出的问题，由于种鸡强制换羽的原因，商品代肉鸡肉鸭大肠杆菌耐药性非常普遍，免疫抑制病严重，往往出现做药敏常规药物几乎都不敏感的情况，因此对于耐药性大肠杆菌建议使用大肠杆菌终结者～常噬进行净化治疗，对于顽固性耐药性大肠杆菌有特效。
肌腺胃炎随着新玉米的使用，又开始逐渐增加，部分鸡群表现在进雏的1日龄就有肌胃的增生糜烂，并且出现几个疗程都不易控制的情况。前期的肌腺胃炎跟腺病毒的感染有关系，防控前期肌腺胃炎首先要净化腺病毒，还要对症治疗，可以使用卡拉速克+润达腺胃康进行治疗净化;对于顽固性的肌腺胃炎，通常已经造成机体严重的免疫抑制，可以用多福+腺胃康进行治疗净化。饲养管理方面：加强净槽和匀料工作，防止饲料霉变，添加脱霉剂，保持旺盛食欲，同时控制湿度防止湿度过高。
天气变凉通风不足，导致部分区域腺病毒发病率上升，发病率集中在25～35日龄，对机体造成较为严重的免疫抑制和器官损伤，加强净化腺病毒也是本阶段重要的防控措施。可以使用卡拉速克(新流腺抗体)进行净化防控，一般在发病前5天使用净化，也可以用于发病后的治疗，1毫升每公斤体重，防控效果不错。
20~35日龄的鸡群整体状况还在控制范围内，呼吸道症状较为普遍但不是很严重。个别管理不善的鸡舍，出现流感和气囊炎、大肠杆菌混感的情况，发病和死亡较快，死亡率高，治愈难度大;30日龄以后的鸡群，特别注意新城疫的防控，很多养殖场不做新城疫二免，就算做过，也可能失败，导致后期新城疫抗体偏低，不能有效保护鸡群，非典型性新城疫的发病率普遍较高。
肾传支在部分区域流行较为明显，由于同一地区不同养殖公司传支疫苗免疫程序不同，以及不同区域进雏引种问题，导致野毒流行，即使鸡群免疫程序较为完善，免疫抑制的普遍存在，使抗体滴度和均匀度较差，仍然有疫情流行问题。
肾传支的防控要以合理疫苗防控为主，传支的防控仍要强调“死苗+活苗”的结合，不断用活苗进行刺激，建议M株+H120株、M株+QX株、M株+4/91株交替使用，但不提倡所有毒株全部混合使用。同时注意解除免疫抑制和机体抵抗力的提升，防疫前配合使用润达多福。
另外需要注意的是法氏囊病开始零星出现，并且发病症状较为典型，要注意密切观察与防控。
秋冬季肉鸡养殖防疫和用药方面：抓住几个关键点，鸡苗偏弱的情况下，前期(1～15日龄)控制好支原体(MS/MG)，鸡苗较弱的净化2次。解除免疫抑制，提高机体抵抗力，7~10日龄用一次多福， 不能做新城疫二免的可以在17~18日龄，使用多福代替，把抗体水平提升起来;中后期30天左右，在新城疫的防控上，多福使用效果明显，如有流感的混合混合感染，使用新泰能效果更佳。
饲养管理方面：稳定舍温，防止湿度波动太大，秋冬通风不宜调整过大，防止通风受凉，降温时及时点炉提温，防止通风不足。
肉鸭方面南方地区：主要是黄病毒和腺病毒发生率非常高，北方主要是呼吸道疾病明显增多，发病快，多集中于15～30日龄，天气变化后，发病率明显升高，容易继发浆膜炎，气囊炎大肠杆菌，另外北方腺病毒发病率也普遍较高。个别区域出现重症感冒，伤亡率增加迅速，采食量严重下降，做好疫苗防控和通风管理是关键。
肉鸭腺病毒防控可以使用卡拉速克1毫升每公斤体重，黄病毒可以使用疫苗接种，发病时可以紧急免疫，或者使用优质抗体治疗。
小结：关注天气变化，秋冬季温度忽高忽低，及时的调整温度和风机等设备，扩群和免疫前后更要注意，做好生物安全防控工作，尤其是候鸟迁移路线的区域，加强驱鸟工作，防止外来病原的入侵。
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