参考GB/T 16551-2008猪瘟诊断技术和GB/T 27540-2011猪瘟病毒实时荧光RT-PCR检测方法等,以及从NCBI下载近年来流行的猪瘟野毒的基因(组)序列,分别针对猪瘟病毒的5’UTR和E2基因设计特异性引物,对全国各地猪场的病料采用RT-PCR方法检测猪瘟病原。而2019年1-6月份的猪瘟病原阳性率见图3。
2019年上半年检测到猪瘟病原共有2个场次,4份样品,将这些猪瘟病原阳性样品进行送样测序,成功获得相应的基因序列后应用DNAStar软件进行分析和比较,并利用MEGA 6软件绘制系统进化树见图4。根据E2基因部分序列分型的结果显示,1株属于疫苗株,3株属于野毒株,而这3个野毒株都是属于基因2.1型,建议当前要重点警惕基因2.1型野毒株。
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