2018年上半年猪瘟病原检测数据分析

参考GB/T 16551-2008猪瘟诊断技术和GB/T 27540-2011猪瘟病毒实时荧光RT-PCR检测方法等，以及从NCBI下载近年来流行的猪瘟野毒的基因（组）序列，分别针对猪瘟病毒的5’UTR和E2基因设计特异性引物，对全国各地猪场的病料采用RT-PCR方法检测猪瘟病原。而2018年1-6月份的猪瘟病原阳性率见表3和图3。

图3  2018年1-6月份猪瘟病原阳性率统计条形图

2018年上半年检测到猪瘟病原的共有9个场次，16份样品，将这些猪瘟病原阳性样品进行送样测序，成功获得相应的基因序列后应用DNAStar软件进行分析和比较，并利用MEGA 6软件绘制系统进化树（见图4和图5）。尽管根据5’UTR和E2基因部分序列分型的结果会稍微有所不同，但野毒株都是属于基因2.1型，建议当前要重点警惕基因2.1型野毒株。

图4 基于5’UTR部分序列的系统进化树图

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