鸡高致病性H7N9病毒或起源于珠三角

近日，南京农业大学联合扬州大学和中国科学院微生物研究所等单位，在cell系列子刊《Trends in Microbiology》上发表论文，对2013年以来的五轮H7N9流感病毒疫情进行了流行病学研究和分析。
      自2013年3月中国发现了首例人感染H7N9禽流感病毒病例以来，每年冬春季都会出现一波人感染的疫情，截止到2017年5月23日止已有五波共1486人感染H7N9流感病毒，死亡率约为38%。H7N9流感病毒不仅对人类健康造成巨大威胁，也严重威胁我国的养殖业。因此，新出现的对鸡高致病性H7N9禽流感疫情受到全社会的高度关注。

2016年10月开始的第五波H7N9流感病毒感染人的疫情中，不仅感染人数增加，而且在地理位置上出现了向我国西部省份扩散的现象。从第五波疫情开始，部分H7N9病毒出现了变异变成了对鸡高致病性毒株，在湖南、河北等省的部分家禽养殖场也开始爆发新发的高致病性H7N9禽流感病毒疫情，超过30万羽鸡被扑杀。

2017年年初开始，广东和台湾发现部分H7N9病毒在HA蛋白裂解位点插入4个氨基酸（KRTA），可能会导致这些病毒由原来的对鸡不致病转变为高致病性，同时出现了高致病性H7N9病毒感染人的病例，随后湖南、河北等地部分家禽也发生了高致病性H7N9疫情。

图1：（A）截止到2017年4月，H7N9流感病毒感染人的五波疫情中感染病例数与死亡数统计。（B）用RAxML方法系统展示了H7N9流感病毒HA基因的进化树，以病毒shanghai／1/2013 H7N9为根。高致病性H7N9流感病毒用深紫色表示。使用蓝色，黄色与没有颜色来区分病毒的分离于长三角地区，珠三角地区还是其他地区。红色表示人感染的H7N9病毒分离株，无色表示环境或者禽类的H7N9病毒分离株。

研究人员对造成5波疫情的H7N9病毒进行遗传进化分析发现，2015-2016年流行的第四波H7N9流感疫情，病毒全部由之前的三波病毒进化而来，第五轮病毒由第四轮进化树而来，第五轮中的高致病性毒株均来自珠三角区域并形成一个独立的分支，提示高致病性H7N9病毒可能起源于珠三角地区。

研究结果还发现，珠三角与长三角地区人感染H7N9病例数显著高于其他地区，男性病人显著高于女性病例。

图2：（A）用RAxML方法系统展示了H7N9流感病毒NA基因的进化树。（B）利用3D结构模型展示H7N9流感病毒NA蛋白上的耐药基因位点变化。