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斗转星移，岁至丁酉。2017到了鸡年，“鸡年大吉”的祝福语不绝于耳。鸡作为伴随人类文明起源和发展的家养动物，其起源和驯化的历史是怎样的？ 演化至今的家鸡，会有哪些趣闻？借此鸡年之际，基因君想跟大家聊聊鸡的那些有趣的科普故事。
家鸡的起源和驯化
关于家鸡的起源和驯化，这是一个颇有争议的重大科学问题。达尔文曾提出“家鸡在4000年前起源于印度，之后走出亚洲，传播到全世界”的假说，但一直以来缺乏让人信服的证据。近几年，随着基因组学技术的发展，许多家养动物起源和驯化的相关问题得以明了。目前大量研究支持家鸡是多地、多次起源，并由红原鸡驯化而来。家鸡被驯化后可能与其他原鸡（比如灰原鸡）发生杂交，基因组中保留了其他原鸡的遗传组分。
这只仙风道骨般的红原鸡，据说是现在圆鼓鼓的家鸡的祖先
科学家曾指出，没有任何驯化动物像鸡一样，被人类如此广泛地改造和重塑。如今，在人们的喜爱和养殖下，鸡的数量超过了200亿只，成了世界上数量最多的陆生脊椎动物。
遍布全球的鸡让无数科学家着迷。2004年，鸡迎来了最辉煌的时刻。由遗传学家组成的国际鸡基因组测序协会（International Chicken Genome Sequencing Consortium）绘制出了完整的红原鸡基因组图谱。华大基因曾参与其中，还与多国科学家完成了国际家鸡基因组计划。随后，华大基因主导发起和完成了多品系家鸡变异图谱，并建立在线数据库，于国际顶尖杂志、期刊发表了多篇高质量文章。科学家们的这些研究成果揭开了鸡的显赫身世：世上第一种驯养的鸟类动物，也是恐龙的直系后代。鸡的基因组图谱为我们提供了一个极佳的机会，可以研究历经数千年的驯养会对一个物种造成哪些改变。
在鸡的驯化过程中，很多性状呈现出了明显的受选择状态。有两个基因变异对家鸡性状发生的变化可能起了关键的作用。一个是促甲状腺激素受体（TSHR）基因的变异，该基因是在2010年被研究人员发现，它改变了鸡的季节交配模式，从而使鸡能够全年下蛋。鸡一旦开始整年下蛋，就会被圈养起来。另一个是TBC1D1基因发生重要突变，它负责调节糖代谢。在人类基因组中，这个基因的突变与肥胖症有关。既然鸡注定是要上餐桌的，那么多长肉是硬道理。
在原鸡变成家鸡的过程中，人类的作用更是不可忽视。人类的文化交流、贸易、移居和征伐等活动也促进了鸡的驯化和传播。杜伦大学进化遗传学家Greger Larson及其研究团队曾做过研究，发现促甲状腺激素受体（TSHR）基因虽然普遍存在于现代家鸡中，但在古代鸡中却很少能寻觅到踪迹。也就是说，是人类的选择性繁殖（选育的策略）才让该基因被选择性地保留下来，由原来的仙风道骨般的原鸡形象变成了现在圆鼓鼓的家鸡形象。
生物总是在不停演化，驯化不是一个简单的事件，而是一个持续的过程。我们通过不断的研究和分析，完成鸡驯化的故事拼图，随着研究的深入，鸡驯化的故事也将越来越清晰。
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