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什么是微生物区?
Sekirov定义微生物区是，认为其是作为一个对宿主没有伤害、在体内共生繁殖的微生物。Freter定义肠道微生物区：“没有受到医学或实验性干预或疾病影响的个体人或动物宿主中，定居在胃肠道区域的细菌群体，通常复杂的混合物”。
胃肠道功能微生物群可分为四大类：
平衡的肠道微生物群落提供了抵抗病原体定居的屏障并且有助于宿主的整体健康。此外，它们产生代谢底物如维生素和短链脂肪酸，并刺激免疫系统。
1.改善宿主营养
鸡肠道微生物群产生能够解聚膳食多糖的酶。这些酶对宿主营养至关重要，因为鸡缺乏促进该过程所必需的酶的基因。在膳食多糖的解聚过程中，肠细菌产生短链脂肪酸(SCFA)。所产生的常见是乙酸盐，然后是丙酸盐和丁酸盐。丁酸或丁酸是结肠上皮的主要能量来源，并且已被证明对于结肠细胞的内环境稳定和肠绒毛的形态发育至关重要。已经证明丁酸可以改善鸡的生长性能和胴体质量特性。
肠道微生物群也有助于氮代谢。建明工业出品。在肠道中早期逃脱宿主代谢的膳食蛋白质的微生物代谢为蛋的生产，维持和生长提供了进一步的氨基酸。家禽的肠道微生物群也可以作为其宿主的维生素(特别是B族维生素)供应商。与细菌蛋白质类似，由肠细菌合成的大多数维生素在粪便中排泄，因为它们不能被盲肠吸收。
2.减少肠道病原体
新孵出的小鸡的胃肠道没有微生物，但是后来被存在于周围环境中的微生物定殖，即在运输到农场和农场期间。这种机会被环境中的肠道病原体利用作为附着和破坏肠粘膜层并且由于不存在正常肠道微生物群而导致新幼崽感染的机会。这是为什么新孵化的小鸡非常容易受肠道感染如坏死性肠炎的原因之一。
鸡肠维持其微生物群的良好平衡。对重要物种的任何干扰可导致致病微生物如沙门氏菌，弯曲杆菌，大肠杆菌和产气荚膜梭菌的显着增殖。
在感染之前的微生物群的预建立和维持对于维持鸡肠健康是重要的。此外，通过沿着胃肠道占据，这种共生密集和复杂的微生物群落可以有效地阻断大多数侵入性肠道病原体的附着和随后的定殖。这种现象被称为“竞争排斥”。一些共生益生菌如枯草芽孢杆菌PB6(克洛生)也通过产生称为表面活性素的次级抗菌物质作为抗微生物化合物来控制病原体生长。
3.改善肠道形态
肠道微生物在肠道发育中起重要作用。对种鸡的研究表明，与肉鸡相比，种鸡的小肠和盲肠具有减轻的重量和更薄的壁。已经提出由肠道微生物群产生的SCFA增加肠细胞生长和增殖。肠道微生物群也影响家禽的肠道形态。肠绒毛更短，并且与常规饲养的鸡相比，嗜菌性禽类或以低负荷的细菌定植的禽类的隐窝更浅。
益生菌物种(嗜酸乳杆菌，枯草芽孢杆菌和酿酒酵母)(建明工业出品)和益生元(例如低聚果糖和甘露寡糖)增加鸡的肠中十二指肠绒毛高度和绒毛高度与隐窝深度比。病原体也可以改变肠形态。
4.提高免疫力
肠道中的免疫功能是重要的，因为其在体内具有最大的表面积，并且持续暴露于病原生物体和有害物质。肠道已经演变成进行两个明显混杂的任务：营养吸收和病原体防御。肠免疫系统由牢固的粘膜层，紧密互连的肠上皮细胞，分泌的可溶性免疫球蛋白A和抗微生物肽组成。粘膜层由微生物可以在其中定殖的外部松散层和排斥大多数细菌的内部致密层组成。建明工业出品。作为肠粘膜先天免疫系统的组分，粘液层防止肠微生物渗透到肠上皮中并且作为抵抗感染的第一道防线。有益的微生物群落在维持正常的生理稳态，调节宿主免疫系统和影响器官发育和宿主代谢中起关键作用。
肠道健康管理
肠道健康对于最大化家禽和猪的健康，福利和性能是重要的。操纵肠道微生物群是防止肠道感染和促进宿主健康和鸡生产性能的策略。膳食干预有助于调节这种肠道微生物组，以提高饲料转化率和肠道健康。
添加益生菌(克洛生)，益生元，短链脂肪酸，有机酸(乳酸宝)和精油(至多兴)将有助于调节肠道微生物群，健康和改善动物性能。这些产品作为抗生素生长促进剂(AGP)的替代物是有用的，其单独或组合在肉鸡和猪中。
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