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108.中华人民共和国船舶进出渔港签证办法（1990年1月26日农业部令第11号公布，1997年12月25日农业部令第39号修订）
109.黄渤海区对虾亲虾资源管理暂行规定（1990年11月8日〔1990〕农（渔政）字第17号公布，1997年11月25日农业部令第39号、2007年11月8日农业部令第6号修订）
110.农业部关于禁止在公海使用大型流网作业的通知（1991年6月8日〔1991〕农(渔政)字第3号公布）
111.渔港费收规定（1993年10月7日〔1993〕农（渔政）字第15号公布，2011年12月31日农业部令2011年第4号修订）
112.农业部关于实施《清理取缔“三无”船舶通告》有关事项的通知（1994年11月8日〔1994〕农渔发21号公布）
113.长江渔业资源管理规定（1995年9月28日农渔发〔1995〕29号公布，2004年7月1日农业部令第38号修订）
114.农业部、财政部关于下发《沿海和内陆边境水域渔业执法人员制服供应办法》、《内陆水域渔业执法人员制服供应办法》的通知（1996年4月16日农渔发〔1996〕5号公布）
115.水域污染事故渔业损失计算方法规定（1996年10月8日农渔发〔1996〕14号公布）
116.水产品批发市场管理办法（1996年11月27日农渔发〔1996〕13号公布，2007年11月8日农业部令第6号修订）
117.渔业水域污染事故调查处理程序规定（1997年3月26日农业部令第13号公布）
118.中华人民共和国水生动植物自然保护区管理办法（1997年10月17日农业部令第24号公布，2010年11月26日农业部令2010年第11号、2013年12月31日农业部令2013年第5号、2014年4月25日农业部令2014年第3号修订）
119.渔业行政处罚规定（1998年1月5日农业部令第36号公布）
120.渔业船舶船名规定（1998年3月2日农渔发〔1998〕1号公布，2007年11月8日农业部令第6号、2010年11月26日农业部令2010年第11号、2013年12月31日农业部令2013年第5号修订）
121.水产原、良种审定办法（1998年3月2日农渔发〔1998〕2号公布，2004年7月1日农业部令第38号修订）
122.中华人民共和国渔业船舶验船师资格考评管理规定（1998年12月16日农渔发〔1998〕11号公布）
123.吕泗、长江口和舟山渔场部分海域捕捞许可管理规定（1999年2月13日农渔发〔1999〕3号公布）
124.中日渔业协定暂定措施水域管理暂行办法（1999年3月5日农业部令第8号公布，2004年7月1日农业部令第38号修订）
125.中华人民共和国水生野生动物利用特许办法（1999年6月24日农业部令第15号公布，2004年7月1日农业部令第38号、2010年11月26日农业部令2010年第11号、2013年12月31日农业部令2013年第5号修订）
126.中华人民共和国管辖海域外国人、外国船舶渔业活动管理暂行规定（1999年6月24日农业部令第18号公布，2004年7月1日农业部令第38号修订）
127.渔业船舶航行值班准则（试行）（1999年11月8日农渔发〔1999〕10号公布）
128.中华人民共和国渔业行政执法船舶管理办法（2000年6月13日农业部令第33号公布）
129.中华人民共和国渔业港航监督行政处罚规定（2000年6月13日农业部令第34号公布）
130.中韩渔业协定暂定措施水域和过渡水域管理办法（2001年2月16日农业部令第47号公布，2004年7月1日农业部令第38号修订）
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