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洪涝灾害过后的猪场，会因洪涝灾害受到很大影响，因此必须有针对性地采取措施，进行有效应对，以防止灾害蔓延扩大，造成更大的损失。
一、加强猪舍排水和消毒
1、排水：目前很多小型猪场都是依靠山坡而建，或很多是建在比较低洼的田园间，这样排水将会是一个很大的难题，特别是暴雨来临时，在短时间内大量的水往往无法排出，水流入猪舍，将引起猪群受灾。因此为了避免发生这样的情况，必须对猪舍周边的排水沟进行及时的清理或深挖，应急情况下可加高猪舍的门槛，对于比较低洼的猪舍，可采用紧急转移的方法将猪群转走。
2、病死、溺死猪只进行无害化处理：受灾过程中，不少猪只被水冲散、发病，发生大量死亡。死亡猪体内带有大量致病微生物，如不及时进行无害化处理，任其腐烂发臭，病菌会随水流、空气到处扩散，不仅污染环境，还容易引起人、猪疫病流行。对死亡猪只尸体最简单有效的处理方法通知当地无害化处理中心上门收集，统一进行无害化处理；或者请求当地防疫机构给予指导进行科学处理。
3、消毒：积水排净后，要加强消毒。除了清扫、冲刷、洗擦、日晒、焚烧、堆积发酵等物理消毒和生物学消毒方法以外，化学消毒应用最广泛，下面介绍几种常用消毒药品及其使用方法：
石灰水：用新鲜石灰配成的10%~20%的石灰水，可用来消毒场地，粉刷棚圈墙壁、桩柱等。石灰水的配制方法：1公斤生石灰加4~9公斤水。先将生石灰放在桶内，加少量水使其溶解，然后加足水量。石灰水现配现用，放置时间过长会失效。
草木灰水：适用于对棚圈、用具和器械等消毒。草木灰水配制方法：在10公斤水中加2~3公斤新鲜草木灰，加热煮沸（或用热水浸泡3昼夜），待草木灰水澄清后使用，将草木灰水加热后使用才有显著的消毒效果。
烧碱：2%烧碱溶液可用来消毒棚圈、场地、用具和车辆等。3%~5%的烧碱溶液，可消毒被炭疽芽孢污染的地面。消毒棚圈时，将家畜赶（牵）出栏圈，经半天时间，将消毒过的饲槽、水槽、水泥地或木板地用水冲洗后，再让家畜进圈。
过氧乙酸：2%~5%的过氧乙酸溶液，可喷雾消毒棚圈、场地、墙壁、用具、车船、粪便等。
复合酚：复合酚100~300倍液适用于消毒畜舍、场地、污物等。
百毒杀：用百毒杀3000倍稀释液喷洒、冲洗、浸渍，可用来消毒畜舍、环境、机械、器具、种蛋等，百毒杀2000倍液可用于紧急预防畜禽舍的消毒。百毒杀10000~20000倍稀释液可预防储水塔、饮水器被污物堵塞，可以杀死微生物、除藻、除臭、改善水质。
4、灭蚊灭蝇：高湿高温、污水四处横流，最容易滋生蚊虫，附红体病、弓形体病、圆环病毒往往是由蚊虫叮咬所引起。应尽量割除猪舍周边的杂草，定期清理排水沟，搞好栏舍卫生，平时用完的药物瓶子、袋子等不要到处乱扔，要集中安排销毁或深埋。另外在饲料里面添加环丙氨嗪可以有效地清除蚊虫的幼卵，减少蚊虫滋生。
二、突击抓好免疫和检疫监督
特大洪水灾害极易造成疫病流行，一些多年不发生或很少发生的疫病，如猪丹毒、猪肺疫、猪瘟等，可能会因此发生。一些在正常年份不会发生的疾病如炭疽病，也有可能发生。灾后补栏增养也需要及时防疫。因此当前必须突击抓好防疫工作。根据本地畜禽疫病流行情况，突出防疫工作的重点。
洪水灾害使病原大量扩散，疫病极易流行。另外灾后急需补栏，苗猪普遍不足，需要到外地调运，稍有不慎，就会带进疫病。因此检疫检验工作显得尤为重要。这项工作是切断疫源传播，防止疫病传入和流行的关键所在，必须抓好。
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