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一、及时修复建设畜禽圈舍
首先要尽快疏通养殖场的排水通道，排除畜舍内外的积水，以减少蚊虫滋生。及时修复、加固破损的畜舍。如重新建场，畜禽圈舍应建在远离村庄、交通方便、地势高燥和没有污染物污染的地方，圈舍四周应挖排水沟，以减少洪涝灾害时对畜禽生产的危害。
二、搞好畜舍及环境的消毒
及时清除畜禽圈舍及周边溺死的动物尸体、洪水退去后留下的污泥、粪尿及杂物等。对过水地带畜禽生产场所及周边环境、生产工具进行全面彻底地冲洗，冲洗干净后再进行消毒。……死亡畜禽的尸体要进行深埋等无害化处理。清扫后的粪便及污物、杂物等要进行堆积发酵，利用生物热进行消毒处理。要加强通风换气，待舍内清洁干燥后，方可转入畜禽。畜禽转入后，要定期开展杀蚊灭蝇及灭鼠工作，以减少通过蚊虫、老鼠等传播疫病的机会。
三、调整畜禽存栏结构
对低龄、体弱、伤残、病情严重的受淹畜禽要及时淘汰，降低饲养成本。商品畜禽达到出栏标准的要尽快出栏，降低饲养密度。应从无规定动物疫病区调入畜禽，做好灾后畜禽补栏补养工作。鼓励转变生产方式，按标准化的要求，发展适度规模养殖。
四、确保畜禽饲料的安全
加强对灾后饲料的管理，防止霉变饲料对畜禽造成危害。在饲料中加入防霉剂，并将饲料保存在空气流通、清洁干燥的地方，抑制霉菌生长。因洪涝而造成的霉变饲料不能直接饲喂畜禽，以防引发畜禽霉菌病及霉菌毒素中毒。
五、加强畜禽饲养管理
经历了水灾恶劣环境的畜禽，体质下降。在灾后高温高湿的饲养条件下，容易感染发病。因此务必要加强畜禽舍的通风换气，及时更换垫草等，保持畜禽舍干燥卫生，并适时予以降温，给畜禽创造一个良好的生活环境。要根据畜禽不同生长阶段的需要供给营养全面的饲料，适当增喂一些多维、电解质及免疫增强剂等。饲料要少添勤喂，避免发霉。要供给充足、清洁的饮水，饮水中也可加入一些复合维生素，以增强机体抗应激能力和抵抗力。此外，在疫病高发期还要在饲料中添加抗菌素和抗病毒药物，以预防疫病发生。要加强畜禽监测与巡视，仔细观察畜禽活动状况，如有异常应尽快与兽医联系。
六、防止人畜共患病的发生
要加强做好宣传工作，提高饲养人员自我保护的意识，要注意穿工作服（鞋、帽）上岗和养成勤洗水习惯，特别是发现伤口要及时处理及时医治，不可掉以轻心，尽量避免直接接触病死畜禽，防止感染疫病。
七、牧草水灾后管理技术要点
在退水过程中，及时清洗粘糊在牧草茎叶上的污泥，以利牧草恢复正常生长。在退水后及时清理好四周排水沟，排出牧草畦面积水，以减少土地积水时间，保持土壤墒情，能增强植株根系活力，促进植株恢复生长，减轻水害影响。牧草受水害严重的，可能造成地上茎叶倒伏枯萎，先查检几株，观察判断根蔸是否死亡。如果根蔸正常，牧草仍能够恢复生长，可及时刈割地上部受害枯草，以减少牧草水份蒸腾，有利于促进新枝（分蘖）的快速萌发。对水淹时间较长，造成死苗的牧草地，要及时检查、确认，并及时补栽补种，恢复牧草生产。视牧草长势每亩追施尿素10—15㎏或人畜粪尿水10—20担，为牧草生长提供必需的速效肥，利于牧草快速恢复生长。由于牧草受水害影响，抗逆性减弱，抗病虫害能力下降，易受病虫危害。常见病害有锈病、白粉病、霜霉病等，常见虫害有蚜虫、粘虫、菜青虫等。要加强观察，注重防控。
八、做好抗旱准备工作
大涝之后往往有旱情出现，各地在搞好灾后恢复生产工作的同时，一定要警惕涝后旱情的发生。要密切关注天气预报，做好抗旱准备，力争将旱涝灾害造成的损失降到最低程度。
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