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3、反刍动物疫病调查：在辖区的重点县市区选择1个牛羊养殖场（饲养量不小于100头、只）作为流行病学调查点。以调查点为重点区域，随机选择一定数量散养户、规模养殖场和屠宰场进行流行病学调查和采样检测。
（二）常规流行病学调查
根据各县市区疫控中心疫情月报、中国动物疫病预防控制中心季报表以及春秋动物重点疫病检疫净化情况，开展主要动物疫病的流行病学调查与分析工作。
（三）专项调查
根据动物疫病发生发展形势，每年年初确立年度专项调查内容，并制定相应的调查方案，城区重点对动物狂犬病防控进行调查，包括免疫覆盖率、免疫组织管理模式、免疫效果、流浪动物等。其他县区针对高致病性禽流感、口蹄疫等重大疫病，开展免疫效果评价、病原微生物等方面的调查；针对马立克氏病、鸡白痢、牛流行性腹泻等危害畜牧生产严重的疫病进行病原学调查；针对当年新兴起的养殖动物，开展相关疾病的调查。
（四）紧急流行病学调查
怀疑或确认发生以下情况时，省级启动应急预案，并按要求详细、全面、准确收集相关信息，开展紧急流行病学调查工作。流行病学调查专家根据调查情况，描述动物疫情现状（空间、时间和群间分布等），分析疫病来源，判断疫情发展趋势，探病因及风险因素，确定疫病可能扩散范围，预测疫病爆发或流行趋势，提出控制措施建议。
1、发生高致病性禽流感、口蹄疫、高致病性猪蓝耳病、炭疽、狂犬病疫情；
2、猪瘟、新城疫、布鲁氏菌病、结核病、蓝舌病等主要动物疫病发病率或流行特征出现异常变化；
3、发生小反刍兽疫、疯牛病、痒病、非洲猪瘟等外来动物疫病；
4、牛瘟、牛肺疫等已消灭或基本消灭疫病再次发生；
5、较短时间内出现导致较大数量动物发病或死亡且蔓延较快的疫病，或怀疑为新发病的。
三、建立定期专家会商机制
利用畜牧兽医大专院校、科研机构等单位人力和大型畜牧生产单位资源优势，结合动物防疫部门了解生产一线所需的特点，建立定期专家会商机制。
（一）成立专家组。每季度根据实际情况组织动物流行病学调查专家组，开展重大动物疫病发生风险、发生趋势、防控规划及防控技术进行研讨，并形成报告。
（二）有效利用各方面技术资源优势，密切监控外来疫病和新发疫病。建立动物疫病流行病学监测数据库，为开展防范外来重大动物疫病工作提供的前提和基础。
（三）日常信息交流机制。通过这种制度建立，使各部门间互通有无，取长补短，共享信息资源，有效提高对重大疫病或突发事件的应急反应能力，避免工作失误。
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